74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4442 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  445  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  55.2 
 
 
223 aa  231  7.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  31.98 
 
 
217 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.95 
 
 
1171 aa  99.8  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  31.36 
 
 
217 aa  98.2  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.35 
 
 
1180 aa  95.1  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.63 
 
 
1503 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  32.13 
 
 
233 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  30.4 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  29.07 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  33.17 
 
 
220 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.96 
 
 
1265 aa  82  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.7 
 
 
1274 aa  81.6  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  33.17 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  33.17 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  28.31 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  29.68 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  28.31 
 
 
213 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  30.15 
 
 
285 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  29.33 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  28.18 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  32.14 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3547  hypothetical protein  28.99 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  26.36 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  29.22 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.82 
 
 
1505 aa  72.8  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  27.98 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  32.34 
 
 
392 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  25.1 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  31.43 
 
 
1143 aa  68.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  29.76 
 
 
247 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  26.25 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  25.96 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.22 
 
 
478 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  29.41 
 
 
1444 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  29 
 
 
296 aa  65.5  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  25.1 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  28.26 
 
 
275 aa  65.1  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  27.32 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  26.95 
 
 
1135 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  24.09 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  29.07 
 
 
279 aa  63.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
232 aa  62.4  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  26.9 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0465  hypothetical protein  24.32 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  29.83 
 
 
1182 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  25 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  27.98 
 
 
314 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2274  hypothetical protein  27.23 
 
 
243 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.507054 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.01 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  27.42 
 
 
375 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.12 
 
 
1200 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  25.54 
 
 
260 aa  55.1  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  27.4 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  27.92 
 
 
351 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  26.94 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2875  hypothetical protein  28.95 
 
 
228 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  25.71 
 
 
1142 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0382  hypothetical protein  25.23 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  28.08 
 
 
1151 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
277 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  25.95 
 
 
255 aa  48.5  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
800 aa  48.5  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3305  hypothetical protein  27.06 
 
 
218 aa  48.5  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  26.94 
 
 
292 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1628  hypothetical protein  25.44 
 
 
308 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0213  hypothetical protein  20.51 
 
 
223 aa  46.2  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  24.54 
 
 
1138 aa  45.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1276  hypothetical protein  25.17 
 
 
206 aa  45.1  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.415352  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06130  hypothetical protein  28.48 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4910  hypothetical protein  27.36 
 
 
326 aa  42.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1544  hypothetical protein  26.03 
 
 
326 aa  41.6  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377212  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>