30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3305 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3305  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  430  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0059  hypothetical protein  46.73 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  decreased coverage  0.00597084 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06130  hypothetical protein  43.04 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2875  hypothetical protein  46.82 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0382  hypothetical protein  42.08 
 
 		 245 aa  121  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  34.53 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  24.05 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  30.19 
 
 		 1182 aa  58.2  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  30.53 
 
 		 1143 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  27.06 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 245 aa  52.8  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  32.3 
 
 		 392 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.58 
 
 		 1505 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  25.96 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  32.93 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  24.31 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2270  hypothetical protein  28.77 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  27.63 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  23.92 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  23.61 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  25.38 
 
 		 1142 aa  45.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 232 aa  45.1  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  22.97 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  28.21 
 
 		 1194 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  22.92 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  26.15 
 
 		 285 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.27 
 
 		 1265 aa  42  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  27.92 
 
 		 247 aa  41.6  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  24.24 
 
 		 1151 aa  41.6  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>