53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3989 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  446  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  70.89 
 
 
213 aa  327  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  67.61 
 
 
213 aa  320  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  68.08 
 
 
213 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  59.35 
 
 
217 aa  267  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  58.88 
 
 
217 aa  263  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  53.7 
 
 
216 aa  228  7e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  50 
 
 
214 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  49.53 
 
 
214 aa  215  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0465  hypothetical protein  46.79 
 
 
216 aa  191  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  42.72 
 
 
225 aa  178  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  41.67 
 
 
227 aa  174  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  39.91 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  41.67 
 
 
221 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  39.04 
 
 
248 aa  156  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  38.6 
 
 
232 aa  155  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  37.28 
 
 
228 aa  154  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  36.4 
 
 
232 aa  150  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  36.32 
 
 
236 aa  147  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  38.43 
 
 
233 aa  141  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  38.5 
 
 
228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  39.17 
 
 
220 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  39.17 
 
 
220 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  39.17 
 
 
220 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.81 
 
 
1265 aa  79.7  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  29.22 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.76 
 
 
1503 aa  65.1  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  27.43 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.87 
 
 
1180 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.03 
 
 
1171 aa  55.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.74 
 
 
1274 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  32.8 
 
 
351 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  25.5 
 
 
276 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  24.1 
 
 
285 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.85 
 
 
232 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3547  hypothetical protein  29.77 
 
 
262 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2274  hypothetical protein  31.19 
 
 
243 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.507054 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  24.88 
 
 
247 aa  48.5  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1544  hypothetical protein  30.48 
 
 
326 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377212  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  29.89 
 
 
314 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2875  hypothetical protein  31.45 
 
 
228 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  24.11 
 
 
233 aa  46.2  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  28.21 
 
 
375 aa  46.2  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  28.37 
 
 
296 aa  45.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  22.5 
 
 
1444 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  25.23 
 
 
243 aa  45.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  22.87 
 
 
1138 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4538  hypothetical protein  29.36 
 
 
290 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0275466  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  25.93 
 
 
392 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3305  hypothetical protein  25.96 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  22.16 
 
 
1135 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0382  hypothetical protein  27.97 
 
 
245 aa  42.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  24.26 
 
 
1151 aa  42  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>