More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21190 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  100 
 
 		 1194 aa  2456    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  37.49 
 
 		 1444 aa  491  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  35.3 
 
 		 1505 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  33.41 
 
 		 1143 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.48 
 
 		 1200 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  32.83 
 
 		 1151 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  32.05 
 
 		 1135 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  32.15 
 
 		 1142 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  31.44 
 
 		 1182 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  30.56 
 
 		 1138 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 800 aa  333  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  31.23 
 
 		 918 aa  275  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  33.73 
 
 		 984 aa  272  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  32.29 
 
 		 941 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  33.62 
 
 		 918 aa  260  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.6 
 
 		 945 aa  258  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.31 
 
 		 953 aa  253  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  31.79 
 
 		 908 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  30.74 
 
 		 909 aa  224  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 232 aa  181  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  40.97 
 
 		 392 aa  179  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 245 aa  160  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 272 aa  158  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  30.48 
 
 		 275 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  31.62 
 
 		 260 aa  131  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  31.34 
 
 		 895 aa  120  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  31.3 
 
 		 247 aa  118  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  26.89 
 
 		 279 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  32.03 
 
 		 375 aa  117  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  31.69 
 
 		 285 aa  112  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  30.35 
 
 		 292 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  30.53 
 
 		 255 aa  110  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  32.43 
 
 		 276 aa  108  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 277 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2104  hypothetical protein  31.62 
 
 		 894 aa  98.2  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.788762  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  29.6 
 
 		 212 aa  97.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  25.97 
 
 		 231 aa  89.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  30.4 
 
 		 585 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  28.46 
 
 		 346 aa  83.2  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2463  hypothetical protein  29 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.67 
 
 		 809 aa  77.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  26.87 
 
 		 342 aa  77.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  28.87 
 
 		 2172 aa  77  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.73 
 
 		 387 aa  76.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  23.61 
 
 		 258 aa  76.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  28.7 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  30.23 
 
 		 475 aa  73.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  29.44 
 
 		 422 aa  73.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.71 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  29.65 
 
 		 471 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.52 
 
 		 396 aa  71.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  32.74 
 
 		 1029 aa  70.1  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  30.21 
 
 		 400 aa  69.7  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  30.09 
 
 		 482 aa  69.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  40.71 
 
 		 1120 aa  69.3  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  44.05 
 
 		 2122 aa  69.3  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.24 
 
 		 836 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  38.97 
 
 		 840 aa  68.9  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  38.71 
 
 		 978 aa  68.2  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.72 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.34 
 
 		 442 aa  67.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  53.12 
 
 		 2000 aa  67.8  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  46.25 
 
 		 938 aa  67.4  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.21 
 
 		 1158 aa  67.8  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  26.12 
 
 		 999 aa  67.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  26.91 
 
 		 1081 aa  67.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  29.67 
 
 		 371 aa  67.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  47.89 
 
 		 918 aa  67  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  26.12 
 
 		 999 aa  67.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  27.57 
 
 		 394 aa  66.6  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.57 
 
 		 369 aa  66.2  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  29.54 
 
 		 1300 aa  66.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.12 
 
 		 1503 aa  66.2  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  40.82 
 
 		 1682 aa  66.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  28.17 
 
 		 386 aa  66.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.68 
 
 		 570 aa  65.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.63 
 
 		 1180 aa  65.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2243  protein of unknown function DUF1080  29.11 
 
 		 884 aa  65.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  30.08 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  51.52 
 
 		 1969 aa  65.5  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  28.25 
 
 		 408 aa  64.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  25 
 
 		 999 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.46 
 
 		 835 aa  64.3  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.46 
 
 		 835 aa  64.3  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  26.13 
 
 		 399 aa  63.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  41.57 
 
 		 1842 aa  63.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  50 
 
 		 575 aa  63.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  46.25 
 
 		 3295 aa  63.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3035  hypothetical protein  29.13 
 
 		 413 aa  63.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00444174  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  28.63 
 
 		 1140 aa  63.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  22.94 
 
 		 266 aa  63.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.18 
 
 		 1171 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  29.31 
 
 		 1145 aa  63.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  41.24 
 
 		 1094 aa  63.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.26 
 
 		 1265 aa  63.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  44.58 
 
 		 2272 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  38.98 
 
 		 1882 aa  63.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.1 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  27.49 
 
 		 1657 aa  62.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.54 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>