198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2243 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2243  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 884 aa  1785    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2104  hypothetical protein  36.09 
 
 		 894 aa  456  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.788762  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  32.19 
 
 		 1444 aa  106  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.44 
 
 		 527 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28 
 
 		 547 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.78 
 
 		 547 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0134  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase  29.03 
 
 		 480 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.18 
 
 		 526 aa  73.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.03 
 
 		 578 aa  73.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  26.85 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  32.29 
 
 		 1505 aa  69.7  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.9 
 
 		 522 aa  68.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.09 
 
 		 563 aa  68.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.9 
 
 		 522 aa  68.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.72 
 
 		 523 aa  68.6  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  27.7 
 
 		 528 aa  67  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  27.36 
 
 		 563 aa  67  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4268  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 		 528 aa  67.8  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.3626 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.36 
 
 		 548 aa  67.4  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1154  GMC oxidoreductase  34.75 
 
 		 547 aa  67.4  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.57 
 
 		 553 aa  67.4  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.49 
 
 		 545 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  27.36 
 
 		 563 aa  67  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2390  GMC oxidoreductase  34.3 
 
 		 546 aa  67  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2465  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 581 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  27.4 
 
 		 547 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0422  GMC oxidoreductase  36.23 
 
 		 568 aa  66.6  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0827  GMC oxidoreductase  33.12 
 
 		 579 aa  67  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.705708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  29.86 
 
 		 558 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  27.36 
 
 		 563 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0978  hypothetical protein  28.28 
 
 		 502 aa  66.2  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.667371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  27.56 
 
 		 522 aa  65.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  29.11 
 
 		 1194 aa  65.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.06 
 
 		 570 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3857  putative oxidoreductase  30.73 
 
 		 579 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.43 
 
 		 572 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.36 
 
 		 566 aa  65.1  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.43 
 
 		 522 aa  64.7  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.54 
 
 		 549 aa  64.7  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.14 
 
 		 522 aa  64.7  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.79 
 
 		 522 aa  64.3  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2463  hypothetical protein  30.28 
 
 		 257 aa  64.3  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2728  putative oxidoreductase  31.47 
 
 		 567 aa  63.9  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.43 
 
 		 534 aa  63.9  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.11 
 
 		 563 aa  63.9  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4949  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.33 
 
 		 574 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.19 
 
 		 565 aa  63.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2912  GMC oxidoreductase  26.88 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25 
 
 		 526 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  27.49 
 
 		 522 aa  62.4  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01675  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  27.39 
 
 		 647 aa  62  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.69 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4367  GMC oxidoreductase  26.27 
 
 		 554 aa  61.6  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.86 
 
 		 548 aa  61.2  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.07 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2515  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.98 
 
 		 518 aa  61.2  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611733  normal  0.0157209 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.74 
 
 		 533 aa  60.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.19 
 
 		 553 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.56 
 
 		 528 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.6 
 
 		 522 aa  59.7  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.39 
 
 		 544 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.56 
 
 		 545 aa  59.7  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2609  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.21 
 
 		 578 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00973308  normal  0.475535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.86 
 
 		 536 aa  58.9  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1347  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.79 
 
 		 666 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0384946  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.19 
 
 		 582 aa  58.9  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  26.88 
 
 		 528 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.67 
 
 		 562 aa  58.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4426  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.08 
 
 		 579 aa  58.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.03 
 
 		 520 aa  58.2  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.93 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1033  putative oxidoreductase chain  30.37 
 
 		 574 aa  58.2  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0731446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.94 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5620  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.94 
 
 		 579 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.62 
 
 		 527 aa  57  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.03 
 
 		 573 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.96 
 
 		 550 aa  57.4  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2167  GMC oxidoreductase  29.77 
 
 		 545 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.97 
 
 		 560 aa  57.4  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.53 
 
 		 569 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0955213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5079  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.66 
 
 		 569 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1884  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 		 562 aa  56.2  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.86 
 
 		 540 aa  56.6  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.97 
 
 		 566 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.34 
 
 		 515 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.3 
 
 		 579 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.8 
 
 		 581 aa  56.2  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  39.34 
 
 		 745 aa  55.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  26.95 
 
 		 539 aa  55.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.72 
 
 		 572 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4714  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.66 
 
 		 570 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.688275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  25.11 
 
 		 231 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.7 
 
 		 526 aa  55.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0331  GMC oxidoreductase  26.63 
 
 		 557 aa  55.1  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2378  GMC oxidoreductase  26.15 
 
 		 581 aa  55.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.06 
 
 		 538 aa  55.1  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.14 
 
 		 561 aa  54.7  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.35 
 
 		 570 aa  54.7  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0454  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.53 
 
 		 570 aa  54.7  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.59 
 
 		 531 aa  54.7  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>