66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1804 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  553  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 232 aa  242  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  54.84 
 
 		 1505 aa  231  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  54.17 
 
 		 392 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  49.77 
 
 		 1138 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  46.78 
 
 		 1444 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  48.84 
 
 		 1143 aa  203  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  45.7 
 
 		 1182 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  45.33 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  47 
 
 		 245 aa  196  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  44.75 
 
 		 1135 aa  188  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  42.61 
 
 		 1151 aa  188  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 272 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 800 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  39.66 
 
 		 247 aa  185  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  42.92 
 
 		 1142 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  41.56 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  40.37 
 
 		 895 aa  166  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  39.3 
 
 		 255 aa  165  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  39.15 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  38.49 
 
 		 346 aa  145  9e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  39.21 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  37.05 
 
 		 1200 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  37.72 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  32.59 
 
 		 1194 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  30.74 
 
 		 292 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  31.54 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  31.45 
 
 		 351 aa  90.1  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  29.88 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  26.36 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  24.14 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.86 
 
 		 601 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  31.98 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.16 
 
 		 1503 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  25.31 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  26.98 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  26.73 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  27.72 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  26.63 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  26.14 
 
 		 314 aa  62  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.12 
 
 		 1171 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06130  hypothetical protein  31.47 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  26.21 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  27.89 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2624  hypothetical protein  28.57 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.440357  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  27.4 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0591  hypothetical protein  26.14 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.49 
 
 		 1180 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1086  hypothetical protein  30.06 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.978408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  25.44 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  26.13 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  25.5 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.73 
 
 		 478 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.91 
 
 		 1274 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1544  hypothetical protein  22.61 
 
 		 326 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  28.57 
 
 		 639 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.28 
 
 		 1265 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  24.23 
 
 		 213 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  26.32 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3305  hypothetical protein  27.86 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  26.9 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  23.86 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  26.47 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4538  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0275466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0382  hypothetical protein  27.88 
 
 		 245 aa  43.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>