53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4699 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  500  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  28.18 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  27.27 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  30.52 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1544  hypothetical protein  26.3 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.24 
 
 		 1171 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  25.78 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0591  hypothetical protein  24.17 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  28.24 
 
 		 285 aa  62  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.46 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.65 
 
 		 1265 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.29 
 
 		 1180 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  25.48 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  25.98 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  26.9 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  24.74 
 
 		 276 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  26.9 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1628  hypothetical protein  25 
 
 		 308 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107421  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  26.4 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  33.87 
 
 		 1143 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  29.91 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  30.25 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  24.7 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  26 
 
 		 392 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  23.84 
 
 		 1200 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 800 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  33.98 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  33.98 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0382  hypothetical protein  27.18 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  25.15 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3471  hypothetical protein  24.8 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0143  hypothetical protein  26.79 
 
 		 261 aa  45.4  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  25.23 
 
 		 214 aa  45.4  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  25.73 
 
 		 1444 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  24.54 
 
 		 1135 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  31.15 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06130  hypothetical protein  28.57 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4538  hypothetical protein  28.07 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0275466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  23.78 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3547  hypothetical protein  23.39 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  31 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  25.81 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2944  hypothetical protein  29.03 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4438  hypothetical protein  29.03 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  25 
 
 		 275 aa  42.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.79 
 
 		 1503 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.63 
 
 		 1274 aa  42  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  24.53 
 
 		 220 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  24.53 
 
 		 220 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0308  hypothetical protein  28.42 
 
 		 269 aa  42  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  24.53 
 
 		 220 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>