73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1518 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  99.09 
 
 		 220 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  45.41 
 
 		 217 aa  174  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  42.4 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  40.55 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  40.18 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3989  hypothetical protein  39.17 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  38.71 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  38.71 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  39.3 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  38.18 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  37.73 
 
 		 233 aa  131  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20450  hypothetical protein  37.23 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0136  hypothetical protein  37.39 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  35.81 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  37.12 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  34.18 
 
 		 236 aa  118  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  37.21 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0465  hypothetical protein  32.88 
 
 		 216 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0120  hypothetical protein  35.45 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1192  hypothetical protein  31.9 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00959683  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3860  hypothetical protein  35.51 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0231605  normal  0.114316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4188  hypothetical protein  33.94 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  33.17 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.89 
 
 		 1180 aa  78.6  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.64 
 
 		 1171 aa  76.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.76 
 
 		 1265 aa  75.9  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.01 
 
 		 1503 aa  72.4  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  29.89 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  26.38 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.11 
 
 		 1274 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  28.5 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0213  hypothetical protein  25.14 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3547  hypothetical protein  39.6 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3566  hypothetical protein  27.05 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35008  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  24.47 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  31.32 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.78 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  28 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  28.95 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.88 
 
 		 1200 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0591  hypothetical protein  25.25 
 
 		 327 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  27.53 
 
 		 1505 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2875  hypothetical protein  30.47 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.398365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  27.4 
 
 		 1444 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  30.4 
 
 		 351 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  25 
 
 		 1138 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  27.27 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  24 
 
 		 285 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  25.4 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1276  hypothetical protein  25.43 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.415352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  25.61 
 
 		 1182 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  25.13 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  26.32 
 
 		 1194 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  25.73 
 
 		 1135 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  27.86 
 
 		 1151 aa  45.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  26.32 
 
 		 1142 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0382  hypothetical protein  26.35 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4438  hypothetical protein  27.84 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3258  protein of unknown function DUF1037  32 
 
 		 261 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.955275  normal  0.458439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  25.5 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2274  hypothetical protein  27.21 
 
 		 243 aa  42.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.507054 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  25.41 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  23.59 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5495  protein of unknown function DUF1037  32 
 
 		 261 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0242413 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0308  hypothetical protein  34 
 
 		 269 aa  42  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2944  hypothetical protein  34 
 
 		 261 aa  42  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  23.23 
 
 		 255 aa  42  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  24.82 
 
 		 1143 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>