33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4438 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4438  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  538  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3258  protein of unknown function DUF1037  71.26 
 
 		 261 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.955275  normal  0.458439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3007  protein of unknown function DUF1037  71.65 
 
 		 261 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5495  protein of unknown function DUF1037  72.03 
 
 		 261 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0242413 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0308  hypothetical protein  72.03 
 
 		 269 aa  391  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5571  trehalose utilization-related protein  68.58 
 
 		 261 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.972034  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2944  hypothetical protein  70.88 
 
 		 261 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0143  hypothetical protein  68.58 
 
 		 261 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3808  hypothetical protein  69.35 
 
 		 297 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0027  hypothetical protein  62.84 
 
 		 259 aa  343  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2986  hypothetical protein  61.69 
 
 		 247 aa  300  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.102363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3205  hypothetical protein  56.7 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2202  protein of unknown function DUF1037  60.73 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.468062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2950  protein of unknown function DUF1037  61.93 
 
 		 249 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2327  protein of unknown function DUF1037  61.01 
 
 		 237 aa  280  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.74481  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2966  protein of unknown function DUF1037  54.92 
 
 		 248 aa  271  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1236  protein of unknown function DUF1037  54.66 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1145  protein of unknown function DUF1037  58.18 
 
 		 265 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3349  protein of unknown function DUF1037  56.62 
 
 		 236 aa  263  3e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4342  hypothetical protein  59.55 
 
 		 269 aa  262  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  decreased coverage  0.000860336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0127  hypothetical protein  59.09 
 
 		 253 aa  261  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1570  protein of unknown function DUF1037  56.5 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0388  protein of unknown function DUF1037  55.17 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22301  decreased coverage  0.00488955 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4439  protein of unknown function DUF1037  55.45 
 
 		 240 aa  255  5e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0057675  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3775  protein of unknown function DUF1037  54.26 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1353  protein of unknown function DUF1037  61.93 
 
 		 247 aa  251  6e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3468  hypothetical protein  52.27 
 
 		 257 aa  251  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27080  trehalose utilization protein  53.31 
 
 		 261 aa  250  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17810  trehalose utilization protein  53.64 
 
 		 266 aa  247  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577067  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3683  hypothetical protein  50.42 
 
 		 249 aa  247  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1858  protein of unknown function DUF1037  51.13 
 
 		 242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1631  hypothetical protein  39.73 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4699  hypothetical protein  29.03 
 
 		 243 aa  42.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.474373  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>