32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0388 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0388  protein of unknown function DUF1037  100 
 
 		 260 aa  533  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22301  decreased coverage  0.00488955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3468  hypothetical protein  74.21 
 
 		 257 aa  408  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17810  trehalose utilization protein  69.69 
 
 		 266 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577067  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1145  protein of unknown function DUF1037  66.11 
 
 		 265 aa  338  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27080  trehalose utilization protein  57.69 
 
 		 261 aa  296  3e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3683  hypothetical protein  58.51 
 
 		 249 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1858  protein of unknown function DUF1037  59.48 
 
 		 242 aa  287  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2950  protein of unknown function DUF1037  61.4 
 
 		 249 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2202  protein of unknown function DUF1037  59.73 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.468062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0027  hypothetical protein  57.27 
 
 		 259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2986  hypothetical protein  58.26 
 
 		 247 aa  271  8.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.102363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5571  trehalose utilization-related protein  57.78 
 
 		 261 aa  271  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.972034  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0127  hypothetical protein  60.35 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4342  hypothetical protein  61.43 
 
 		 269 aa  265  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  decreased coverage  0.000860336 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0143  hypothetical protein  57.64 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3205  hypothetical protein  54.59 
 
 		 267 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2944  hypothetical protein  55.46 
 
 		 261 aa  261  6.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0308  hypothetical protein  56.77 
 
 		 269 aa  261  6.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1236  protein of unknown function DUF1037  57.14 
 
 		 239 aa  260  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2966  protein of unknown function DUF1037  57.27 
 
 		 248 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1570  protein of unknown function DUF1037  56.7 
 
 		 240 aa  258  8e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3808  hypothetical protein  56.7 
 
 		 297 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4438  hypothetical protein  55.17 
 
 		 261 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3007  protein of unknown function DUF1037  56.82 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3349  protein of unknown function DUF1037  54.34 
 
 		 236 aa  253  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4439  protein of unknown function DUF1037  55.66 
 
 		 240 aa  250  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0057675  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3258  protein of unknown function DUF1037  56.36 
 
 		 261 aa  248  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.955275  normal  0.458439 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5495  protein of unknown function DUF1037  55.91 
 
 		 261 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0242413 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2327  protein of unknown function DUF1037  55.2 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.74481  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3775  protein of unknown function DUF1037  54.95 
 
 		 249 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1353  protein of unknown function DUF1037  59.28 
 
 		 247 aa  245  6e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1631  hypothetical protein  42.98 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>