32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3007 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3007  protein of unknown function DUF1037  100 
 
 
261 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3258  protein of unknown function DUF1037  95.79 
 
 
261 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.955275  normal  0.458439 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5495  protein of unknown function DUF1037  96.17 
 
 
261 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0242413 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3808  hypothetical protein  84.67 
 
 
297 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0308  hypothetical protein  81.61 
 
 
269 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2944  hypothetical protein  80.46 
 
 
261 aa  438  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5571  trehalose utilization-related protein  78.93 
 
 
261 aa  431  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.972034  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0143  hypothetical protein  73.56 
 
 
261 aa  411  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4438  hypothetical protein  71.65 
 
 
261 aa  397  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319512  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0027  hypothetical protein  61.3 
 
 
259 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3205  hypothetical protein  59.39 
 
 
267 aa  321  7e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2986  hypothetical protein  65.13 
 
 
247 aa  316  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.102363  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2950  protein of unknown function DUF1037  66.06 
 
 
249 aa  297  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2202  protein of unknown function DUF1037  58.12 
 
 
240 aa  290  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.468062  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2966  protein of unknown function DUF1037  57.61 
 
 
248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2327  protein of unknown function DUF1037  57.74 
 
 
237 aa  276  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.74481  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3349  protein of unknown function DUF1037  58.33 
 
 
236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1236  protein of unknown function DUF1037  57.8 
 
 
239 aa  267  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1353  protein of unknown function DUF1037  62.84 
 
 
247 aa  262  4.999999999999999e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0127  hypothetical protein  59.09 
 
 
253 aa  261  6e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3683  hypothetical protein  57.33 
 
 
249 aa  259  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1145  protein of unknown function DUF1037  55.45 
 
 
265 aa  259  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1570  protein of unknown function DUF1037  55.51 
 
 
240 aa  259  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4342  hypothetical protein  57.73 
 
 
269 aa  258  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  decreased coverage  0.000860336 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3468  hypothetical protein  54.09 
 
 
257 aa  255  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17810  trehalose utilization protein  55.91 
 
 
266 aa  254  8e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577067  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0388  protein of unknown function DUF1037  56.82 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22301  decreased coverage  0.00488955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3775  protein of unknown function DUF1037  52.7 
 
 
249 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4439  protein of unknown function DUF1037  54.42 
 
 
240 aa  249  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0057675  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27080  trehalose utilization protein  55.11 
 
 
261 aa  245  6.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1858  protein of unknown function DUF1037  54.3 
 
 
242 aa  241  7e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1631  hypothetical protein  37.44 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>