35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3258 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3258  protein of unknown function DUF1037  100 
 
 
261 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.955275  normal  0.458439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3007  protein of unknown function DUF1037  95.79 
 
 
261 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5495  protein of unknown function DUF1037  94.25 
 
 
261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0242413 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3808  hypothetical protein  83.14 
 
 
297 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0308  hypothetical protein  80.84 
 
 
269 aa  438  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2944  hypothetical protein  79.69 
 
 
261 aa  435  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5571  trehalose utilization-related protein  78.93 
 
 
261 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.972034  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0143  hypothetical protein  73.18 
 
 
261 aa  407  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4438  hypothetical protein  71.26 
 
 
261 aa  397  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319512  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0027  hypothetical protein  61.3 
 
 
259 aa  336  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3205  hypothetical protein  59 
 
 
267 aa  316  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2986  hypothetical protein  65.13 
 
 
247 aa  313  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.102363  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2950  protein of unknown function DUF1037  65.6 
 
 
249 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2202  protein of unknown function DUF1037  57.26 
 
 
240 aa  287  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.468062  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2966  protein of unknown function DUF1037  57.2 
 
 
248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3349  protein of unknown function DUF1037  57.76 
 
 
236 aa  274  8e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2327  protein of unknown function DUF1037  55.65 
 
 
237 aa  268  7e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.74481  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1236  protein of unknown function DUF1037  57.8 
 
 
239 aa  263  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1570  protein of unknown function DUF1037  55.41 
 
 
240 aa  261  6e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1353  protein of unknown function DUF1037  59.74 
 
 
247 aa  259  4e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0127  hypothetical protein  57.39 
 
 
253 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3683  hypothetical protein  54.85 
 
 
249 aa  258  8e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4342  hypothetical protein  56.09 
 
 
269 aa  256  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  decreased coverage  0.000860336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1145  protein of unknown function DUF1037  53.64 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3468  hypothetical protein  53.64 
 
 
257 aa  251  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4439  protein of unknown function DUF1037  54.87 
 
 
240 aa  249  3e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0057675  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17810  trehalose utilization protein  55 
 
 
266 aa  249  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577067  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0388  protein of unknown function DUF1037  56.36 
 
 
260 aa  248  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22301  decreased coverage  0.00488955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3775  protein of unknown function DUF1037  52.25 
 
 
249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27080  trehalose utilization protein  52.89 
 
 
261 aa  241  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1858  protein of unknown function DUF1037  50 
 
 
242 aa  235  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1631  hypothetical protein  37.44 
 
 
233 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  32 
 
 
220 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  32 
 
 
220 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  32 
 
 
220 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>