32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3808 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3808  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  608  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3007  protein of unknown function DUF1037  84.67 
 
 		 261 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3258  protein of unknown function DUF1037  83.14 
 
 		 261 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.955275  normal  0.458439 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5495  protein of unknown function DUF1037  83.14 
 
 		 261 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0242413 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0308  hypothetical protein  82.02 
 
 		 269 aa  457  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2944  hypothetical protein  80.84 
 
 		 261 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5571  trehalose utilization-related protein  77.78 
 
 		 261 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.972034  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0143  hypothetical protein  75.86 
 
 		 261 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4438  hypothetical protein  69.35 
 
 		 261 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0027  hypothetical protein  61.69 
 
 		 259 aa  339  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3205  hypothetical protein  60.75 
 
 		 267 aa  325  6e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2986  hypothetical protein  65.13 
 
 		 247 aa  313  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.102363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2950  protein of unknown function DUF1037  63.51 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2202  protein of unknown function DUF1037  57.81 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.468062  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2966  protein of unknown function DUF1037  54.92 
 
 		 248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2327  protein of unknown function DUF1037  59.17 
 
 		 237 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.74481  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1236  protein of unknown function DUF1037  58.11 
 
 		 239 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3349  protein of unknown function DUF1037  56.39 
 
 		 236 aa  268  5.9999999999999995e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0127  hypothetical protein  58.26 
 
 		 253 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1570  protein of unknown function DUF1037  55.9 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3683  hypothetical protein  55.56 
 
 		 249 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3468  hypothetical protein  55 
 
 		 257 aa  258  7e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4342  hypothetical protein  57.39 
 
 		 269 aa  258  7e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  decreased coverage  0.000860336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0388  protein of unknown function DUF1037  56.7 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22301  decreased coverage  0.00488955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3775  protein of unknown function DUF1037  54.5 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1353  protein of unknown function DUF1037  61.86 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1858  protein of unknown function DUF1037  54.2 
 
 		 242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17810  trehalose utilization protein  55.45 
 
 		 266 aa  251  7e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577067  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1145  protein of unknown function DUF1037  53.18 
 
 		 265 aa  248  8e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4439  protein of unknown function DUF1037  53.78 
 
 		 240 aa  248  9e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0057675  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27080  trehalose utilization protein  54.42 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1631  hypothetical protein  39.27 
 
 		 233 aa  176  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>