33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1145 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1145  protein of unknown function DUF1037  100 
 
 
265 aa  538  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17810  trehalose utilization protein  62.36 
 
 
266 aa  349  3e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577067  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0388  protein of unknown function DUF1037  66.11 
 
 
260 aa  340  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22301  decreased coverage  0.00488955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3468  hypothetical protein  63.37 
 
 
257 aa  335  5e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27080  trehalose utilization protein  63.32 
 
 
261 aa  299  3e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3683  hypothetical protein  56.78 
 
 
249 aa  288  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2986  hypothetical protein  60.44 
 
 
247 aa  287  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.102363  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1858  protein of unknown function DUF1037  55.56 
 
 
242 aa  276  3e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2950  protein of unknown function DUF1037  57.59 
 
 
249 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2966  protein of unknown function DUF1037  56.56 
 
 
248 aa  271  7e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3349  protein of unknown function DUF1037  57.01 
 
 
236 aa  268  5.9999999999999995e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2202  protein of unknown function DUF1037  55.07 
 
 
240 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.468062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3205  hypothetical protein  54.59 
 
 
267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0027  hypothetical protein  54.5 
 
 
259 aa  265  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4438  hypothetical protein  58.18 
 
 
261 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319512  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4342  hypothetical protein  57.71 
 
 
269 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  decreased coverage  0.000860336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3007  protein of unknown function DUF1037  55.45 
 
 
261 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5571  trehalose utilization-related protein  54.46 
 
 
261 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.972034  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2944  hypothetical protein  55.66 
 
 
261 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0308  hypothetical protein  56.11 
 
 
269 aa  259  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0127  hypothetical protein  57.27 
 
 
253 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1570  protein of unknown function DUF1037  53.95 
 
 
240 aa  257  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0143  hypothetical protein  55.91 
 
 
261 aa  255  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3258  protein of unknown function DUF1037  53.64 
 
 
261 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.955275  normal  0.458439 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5495  protein of unknown function DUF1037  53.64 
 
 
261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0242413 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2327  protein of unknown function DUF1037  55.66 
 
 
237 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.74481  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4439  protein of unknown function DUF1037  54.22 
 
 
240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0057675  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1236  protein of unknown function DUF1037  54.26 
 
 
239 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3808  hypothetical protein  53.18 
 
 
297 aa  248  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1353  protein of unknown function DUF1037  58.3 
 
 
247 aa  246  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3775  protein of unknown function DUF1037  47.37 
 
 
249 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1631  hypothetical protein  41.52 
 
 
233 aa  206  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.15 
 
 
1274 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>