167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4288 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  61.77 
 
 		 1265 aa  1603    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  44.15 
 
 		 1180 aa  790    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  42.19 
 
 		 1503 aa  701    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  50.41 
 
 		 1171 aa  850    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 1274 aa  2639    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.46 
 
 		 705 aa  225  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.17 
 
 		 1162 aa  207  9e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.54 
 
 		 1193 aa  207  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.36 
 
 		 1181 aa  205  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.82 
 
 		 957 aa  196  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.06 
 
 		 712 aa  195  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.35 
 
 		 1149 aa  194  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.3 
 
 		 951 aa  192  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.19 
 
 		 1306 aa  192  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.14 
 
 		 1068 aa  183  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.45 
 
 		 1055 aa  182  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  27.52 
 
 		 1139 aa  173  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.09 
 
 		 759 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.74 
 
 		 852 aa  162  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.59 
 
 		 1286 aa  161  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  28.6 
 
 		 756 aa  155  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.66 
 
 		 1390 aa  153  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.13 
 
 		 1084 aa  151  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.67 
 
 		 762 aa  141  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.01 
 
 		 868 aa  136  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.24 
 
 		 749 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.5 
 
 		 1040 aa  130  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.1 
 
 		 773 aa  125  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.86 
 
 		 1027 aa  119  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.56 
 
 		 1023 aa  110  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  43.85 
 
 		 147 aa  103  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  31.78 
 
 		 1439 aa  103  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  44.35 
 
 		 673 aa  102  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.38 
 
 		 1201 aa  98.2  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.04 
 
 		 968 aa  95.9  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  25.87 
 
 		 1141 aa  95.1  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  26.09 
 
 		 1110 aa  94.7  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  42.48 
 
 		 722 aa  93.6  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  27.95 
 
 		 306 aa  93.2  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  28.73 
 
 		 296 aa  90.1  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  39.52 
 
 		 373 aa  90.1  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  37.1 
 
 		 669 aa  89.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  25.42 
 
 		 1137 aa  84.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  24.06 
 
 		 1058 aa  84  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  24.55 
 
 		 1143 aa  84  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4442  hypothetical protein  28.7 
 
 		 219 aa  81.6  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0485245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  23.04 
 
 		 466 aa  80.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1600  hypothetical protein  29.15 
 
 		 227 aa  78.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988724  normal  0.695323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.79 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  25.14 
 
 		 381 aa  77.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  25.07 
 
 		 384 aa  77  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4406  hypothetical protein  28.86 
 
 		 217 aa  76.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192664  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  25.6 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3453  hypothetical protein  27.86 
 
 		 217 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0811  hypothetical protein  25.57 
 
 		 245 aa  74.3  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.8275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  41.75 
 
 		 358 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3256  hypothetical protein  28.28 
 
 		 351 aa  72.8  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  27.42 
 
 		 1151 aa  70.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  23.28 
 
 		 377 aa  69.7  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0831  secreted glycosyl hydrolase  27.19 
 
 		 223 aa  67.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.89 
 
 		 478 aa  67.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1906  hypothetical protein  23.18 
 
 		 233 aa  65.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  37.39 
 
 		 164 aa  65.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  29.1 
 
 		 173 aa  65.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0085  hypothetical protein  26.09 
 
 		 232 aa  64.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  23.85 
 
 		 423 aa  63.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3539  hypothetical protein  26.83 
 
 		 514 aa  63.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.294562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  28.12 
 
 		 275 aa  62.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3102  hypothetical protein  27.23 
 
 		 216 aa  62.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  24.72 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5101  hypothetical protein  24.52 
 
 		 228 aa  62.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.204756  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  26.3 
 
 		 357 aa  62  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  22.34 
 
 		 642 aa  62  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  31.4 
 
 		 161 aa  61.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1863  hypothetical protein  24.41 
 
 		 213 aa  60.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285265  normal  0.687336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0975  hypothetical protein  26.74 
 
 		 236 aa  59.7  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0630914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  25.78 
 
 		 880 aa  59.7  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  23.48 
 
 		 346 aa  59.7  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2953  hypothetical protein  24.88 
 
 		 213 aa  59.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  24.14 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5793  hypothetical protein  25.87 
 
 		 233 aa  59.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1682  hypothetical protein  24.41 
 
 		 213 aa  58.9  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0874  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  24.82 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3547  hypothetical protein  25.96 
 
 		 262 aa  58.9  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.31 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0783  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  22.33 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.194417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  26.11 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  29.11 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  29.11 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6252  heme-binding protein  24.65 
 
 		 874 aa  58.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  24.1 
 
 		 421 aa  57.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01580  hypothetical protein  26.88 
 
 		 248 aa  57.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  31.71 
 
 		 159 aa  57.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  24.41 
 
 		 1444 aa  57.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0067  hypothetical protein  25.4 
 
 		 232 aa  57.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  31.9 
 
 		 159 aa  56.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  37.21 
 
 		 150 aa  55.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  23.73 
 
 		 438 aa  55.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  27.85 
 
 		 220 aa  55.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  23.86 
 
 		 361 aa  55.5  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>