31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0335 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 373 aa  779    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  39.95 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  49.57 
 
 		 673 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  46.15 
 
 		 669 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.88 
 
 		 1390 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  47.5 
 
 		 1171 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  39.32 
 
 		 722 aa  96.3  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  41.96 
 
 		 1265 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  39.52 
 
 		 1274 aa  89.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  38.17 
 
 		 1306 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  40.16 
 
 		 1180 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  37.61 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  32.35 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  37.5 
 
 		 164 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  28.8 
 
 		 165 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  31.62 
 
 		 159 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  31.03 
 
 		 159 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  25.86 
 
 		 179 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  25.41 
 
 		 482 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  34.48 
 
 		 969 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  25.93 
 
 		 173 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  30.95 
 
 		 160 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  27.27 
 
 		 287 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4772  protein of unknown function DUF1080  28.69 
 
 		 628 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6139  hypothetical protein  26.19 
 
 		 563 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  24.46 
 
 		 158 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  24.46 
 
 		 158 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  24.46 
 
 		 158 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  24.46 
 
 		 158 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1879  protein of unknown function DUF1080  24.08 
 
 		 629 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.985217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>