55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1172 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 358 aa  743    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  39.95 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  41.8 
 
 		 673 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  35.25 
 
 		 669 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  34.38 
 
 		 722 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.86 
 
 		 1390 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.44 
 
 		 1306 aa  77  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.96 
 
 		 1265 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.72 
 
 		 1180 aa  76.3  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  41.75 
 
 		 1274 aa  73.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.78 
 
 		 1171 aa  63.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  27.45 
 
 		 160 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  35.19 
 
 		 147 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0210  blue (type1) copper domain-containing protein  29.84 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0250042  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  26.92 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  28.68 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  30.08 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  31.85 
 
 		 158 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  25.71 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  31.85 
 
 		 158 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  31.85 
 
 		 158 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  31.97 
 
 		 150 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  31.85 
 
 		 158 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  27.74 
 
 		 155 aa  53.1  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0809  azurin precursor  29.63 
 
 		 158 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  29.71 
 
 		 158 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  29.63 
 
 		 158 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  29.2 
 
 		 158 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  29.2 
 
 		 158 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  33.86 
 
 		 153 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  30.71 
 
 		 150 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0546  azurin precursor  35.23 
 
 		 148 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148254  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  28.38 
 
 		 148 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  27.56 
 
 		 152 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2206  protein of unknown function DUF1080  30.16 
 
 		 478 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  30.56 
 
 		 162 aa  49.3  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  28.69 
 
 		 136 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  33.33 
 
 		 149 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  29.08 
 
 		 151 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  30.65 
 
 		 148 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  36.36 
 
 		 148 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1672  azurin  28.78 
 
 		 151 aa  47  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  30.09 
 
 		 159 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 179 aa  46.6  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  30.65 
 
 		 157 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4088  azurin  34.48 
 
 		 149 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0681809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  29.82 
 
 		 159 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  27.81 
 
 		 149 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6272  protein of unknown function DUF1080  29.1 
 
 		 482 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01601  azurin precursor  22.97 
 
 		 149 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21134  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  31.82 
 
 		 969 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  28.17 
 
 		 150 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  26.95 
 
 		 150 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  26.95 
 
 		 149 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  30.19 
 
 		 164 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>