54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_65000 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  100 
 
 
148 aa  306  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  97.3 
 
 
148 aa  267  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  71.62 
 
 
148 aa  233  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0546  azurin precursor  62.84 
 
 
148 aa  203  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148254  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  65.44 
 
 
136 aa  202  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0658  azurin  65.99 
 
 
149 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000453216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  62.77 
 
 
152 aa  194  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  59.06 
 
 
149 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  59.06 
 
 
150 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0210  blue (type1) copper domain-containing protein  57.93 
 
 
149 aa  190  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0250042  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  64.84 
 
 
155 aa  190  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  57.72 
 
 
150 aa  190  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  57.72 
 
 
150 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01601  azurin precursor  49.32 
 
 
149 aa  170  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21134  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4088  azurin  63.28 
 
 
149 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0681809  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  61.11 
 
 
153 aa  163  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  47.33 
 
 
158 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  47.33 
 
 
158 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  47.33 
 
 
158 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  47.33 
 
 
158 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  53.54 
 
 
157 aa  155  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  48.94 
 
 
149 aa  150  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  45.95 
 
 
150 aa  150  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  50 
 
 
158 aa  149  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  44.16 
 
 
162 aa  148  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0809  azurin precursor  47.68 
 
 
158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0556  blue (type1) copper domain-containing protein  46.81 
 
 
199 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.73332 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  47.33 
 
 
158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  45.27 
 
 
150 aa  141  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  46 
 
 
158 aa  141  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  46 
 
 
158 aa  141  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1672  azurin  42.86 
 
 
151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  42.86 
 
 
151 aa  137  7e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  43.75 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  37.04 
 
 
173 aa  91.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  34.92 
 
 
165 aa  84.3  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  37.01 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  35.97 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  41.18 
 
 
160 aa  60.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  31.09 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  36.47 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  36.05 
 
 
287 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  29.73 
 
 
358 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.59 
 
 
1390 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.41 
 
 
1306 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  34.12 
 
 
241 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.51 
 
 
1265 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 
722 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  30.95 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  30.84 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  29.07 
 
 
669 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  30.23 
 
 
673 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.73 
 
 
1180 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.05 
 
 
1274 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>