47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01601 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01601  azurin precursor  100 
 
 
149 aa  309  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21134  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  57.25 
 
 
158 aa  174  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  57.25 
 
 
158 aa  174  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  57.25 
 
 
158 aa  174  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  57.25 
 
 
158 aa  174  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  51.35 
 
 
148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  51.72 
 
 
152 aa  166  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  54.2 
 
 
155 aa  166  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  53.62 
 
 
162 aa  164  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  54.62 
 
 
136 aa  163  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  54.33 
 
 
148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0658  azurin  57.36 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000453216 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  57.03 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  56.03 
 
 
150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  54.33 
 
 
148 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0546  azurin precursor  50.68 
 
 
148 aa  158  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148254  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  56.56 
 
 
150 aa  157  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0809  azurin precursor  57.66 
 
 
158 aa  155  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  56.93 
 
 
158 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  56.93 
 
 
158 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  56.93 
 
 
158 aa  155  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  56.93 
 
 
158 aa  154  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0210  blue (type1) copper domain-containing protein  52.21 
 
 
149 aa  151  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0250042  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  55.56 
 
 
153 aa  144  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  45.21 
 
 
151 aa  142  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  47.73 
 
 
149 aa  141  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1672  azurin  44.9 
 
 
151 aa  141  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  43.62 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  43.62 
 
 
149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0556  blue (type1) copper domain-containing protein  46.26 
 
 
199 aa  136  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.73332 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  44.44 
 
 
149 aa  135  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  43.62 
 
 
150 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  42.95 
 
 
150 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4088  azurin  47.69 
 
 
149 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0681809  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  34.07 
 
 
173 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  33.07 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  29.92 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  32.35 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  32 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  27.35 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  27.52 
 
 
669 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.91 
 
 
1306 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  28.93 
 
 
287 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  22.97 
 
 
358 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  32.22 
 
 
722 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  26.47 
 
 
673 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.26 
 
 
1274 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>