55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3180 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  100 
 
 
158 aa  323  8.000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  87.26 
 
 
158 aa  283  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  87.26 
 
 
158 aa  283  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  87.26 
 
 
158 aa  283  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  87.26 
 
 
158 aa  283  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  88.54 
 
 
158 aa  267  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  87.26 
 
 
158 aa  264  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  87.26 
 
 
158 aa  264  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0809  azurin precursor  85.99 
 
 
158 aa  256  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  72.55 
 
 
157 aa  222  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  66.46 
 
 
162 aa  219  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  59.6 
 
 
150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  58.94 
 
 
150 aa  178  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01601  azurin precursor  56.93 
 
 
149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21134  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0658  azurin  59.23 
 
 
149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000453216 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  49.33 
 
 
148 aa  167  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  55.3 
 
 
136 aa  166  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  54.93 
 
 
152 aa  165  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  56.82 
 
 
155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  51.97 
 
 
148 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0210  blue (type1) copper domain-containing protein  52.08 
 
 
149 aa  155  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0250042  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  51.18 
 
 
148 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0546  azurin precursor  47.62 
 
 
148 aa  147  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148254  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  49.64 
 
 
149 aa  143  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  45.89 
 
 
150 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  45.89 
 
 
150 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  46.94 
 
 
151 aa  140  7e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0556  blue (type1) copper domain-containing protein  44.68 
 
 
199 aa  140  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.73332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  45.89 
 
 
150 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  45.89 
 
 
149 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  54.76 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1672  azurin  45.64 
 
 
151 aa  138  3e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  42.47 
 
 
149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4088  azurin  51.94 
 
 
149 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0681809  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  50.83 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  41.73 
 
 
173 aa  94  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  32.54 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  38.46 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  34.15 
 
 
179 aa  72  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.88 
 
 
1306 aa  64.7  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  31.01 
 
 
669 aa  60.5  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  30 
 
 
287 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.68 
 
 
1265 aa  58.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  32.41 
 
 
159 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  30.91 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  28.32 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  31.88 
 
 
358 aa  54.3  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.8 
 
 
1274 aa  54.3  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.62 
 
 
1390 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  30.99 
 
 
241 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.36 
 
 
1180 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  25.79 
 
 
673 aa  47.4  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.17 
 
 
1171 aa  44.3  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  27.45 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  25.4 
 
 
722 aa  41.2  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.459048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>