50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4662 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4662  azurin  100 
 
 		 150 aa  307  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  97.33 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  95.33 
 
 		 150 aa  294  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  95.3 
 
 		 149 aa  292  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  66.44 
 
 		 148 aa  207  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0546  azurin precursor  65.77 
 
 		 148 aa  203  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148254  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  65.69 
 
 		 136 aa  189  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5648  azurin precursor  58.59 
 
 		 148 aa  167  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  57.81 
 
 		 148 aa  166  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0658  azurin  57.46 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453216 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0210  blue (type1) copper domain-containing protein  51.33 
 
 		 149 aa  157  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0250042  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  46.58 
 
 		 152 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  47.22 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  47.22 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  47.22 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  47.22 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  42.76 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  49.22 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  45.45 
 
 		 155 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  44.76 
 
 		 149 aa  135  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01601  azurin precursor  43.62 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21134  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  41.38 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  42.96 
 
 		 162 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  42.18 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  45.03 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  45.03 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  45.89 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  48.78 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  43.33 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0809  azurin precursor  43.33 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  36.3 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1672  azurin  36.3 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4088  azurin  45.74 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0681809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0556  blue (type1) copper domain-containing protein  39.46 
 
 		 199 aa  114  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.73332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  33.58 
 
 		 173 aa  80.1  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  34.29 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  33.86 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  32.12 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  30.71 
 
 		 673 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.09 
 
 		 1390 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  34.71 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.77 
 
 		 1265 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  32.2 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  26.77 
 
 		 669 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  34.96 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 287 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.13 
 
 		 1171 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  34.95 
 
 		 160 aa  42.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  28.17 
 
 		 358 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>