69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6137 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  63.88 
 
 		 673 aa  899    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 669 aa  1381    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  57.72 
 
 		 722 aa  798    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3236  cytochrome c class I  48.87 
 
 		 647 aa  492  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0631004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6271  cytochrome c class I  48.68 
 
 		 663 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000987167  normal  0.709184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4773  cytochrome c class I  47.18 
 
 		 669 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2205  cytochrome c class I  44.97 
 
 		 656 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1580  large, multifunctional secreted protein  41.87 
 
 		 506 aa  375  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.10938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1439  hypothetical protein  39.22 
 
 		 509 aa  329  8e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.421301  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1171  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.67 
 
 		 491 aa  308  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0336  hypothetical protein  35.74 
 
 		 502 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0335  blue (type 1) copper domain protein  46.15 
 
 		 373 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.4 
 
 		 1306 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5004  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1010 aa  100  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  43.24 
 
 		 1171 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  40.34 
 
 		 1390 aa  98.2  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  40.71 
 
 		 1265 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  42.11 
 
 		 1180 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1172  blue (type 1) copper domain protein  35.25 
 
 		 358 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.1 
 
 		 1274 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  37.17 
 
 		 147 aa  84  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5289  cytochrome c class I  24.29 
 
 		 920 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  33.57 
 
 		 161 aa  76.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  36.75 
 
 		 179 aa  72.4  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  35.04 
 
 		 165 aa  67.8  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0327  blue (type 1) copper domain protein  39.67 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0741181 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1745  electron transfer protein azurin I  34.81 
 
 		 151 aa  62.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3581  azurin  31.25 
 
 		 158 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3772  azurin  31.25 
 
 		 158 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3649  azurin  31.25 
 
 		 158 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0658  azurin  31.25 
 
 		 158 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1672  azurin  34.81 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  34.55 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0809  azurin precursor  29.38 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3308  blue (type1) copper domain-containing protein  29.38 
 
 		 158 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02282  azurin  29.63 
 
 		 149 aa  57  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0645  blue (type1) copper domain-containing protein  29.38 
 
 		 158 aa  57  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.478569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3478  blue (type1) copper domain-containing protein  29.38 
 
 		 158 aa  57  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3180  azurin  30.38 
 
 		 158 aa  57  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2412  blue (type1) copper domain-containing protein  29.01 
 
 		 173 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  33.91 
 
 		 159 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  33.91 
 
 		 159 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001298  azurin  34.19 
 
 		 150 aa  55.5  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  32.29 
 
 		 160 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05169  azurin  35.04 
 
 		 150 aa  55.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3740  azurin  30.53 
 
 		 162 aa  54.3  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3289  azurin  36.14 
 
 		 149 aa  53.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.949678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  31.5 
 
 		 241 aa  52  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4923  azurin  32.58 
 
 		 136 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2435  azurin  36.36 
 
 		 155 aa  50.8  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.557296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0938  blue (type1) copper domain-containing protein  29.6 
 
 		 157 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000352291  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01601  azurin precursor  27.52 
 
 		 149 aa  49.7  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21134  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4662  azurin  26.77 
 
 		 150 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0388565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  30.83 
 
 		 189 aa  47.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1535  azurin  38.2 
 
 		 153 aa  47.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  26.37 
 
 		 363 aa  47.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000245782  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4088  azurin  35.63 
 
 		 149 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0681809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4870  azurin  26.56 
 
 		 149 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  26.23 
 
 		 164 aa  46.6  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4748  azurin  26.56 
 
 		 150 aa  47  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  30.63 
 
 		 140 aa  47.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4926  azurin  26.56 
 
 		 150 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000893264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0591  blue (type1) copper domain-containing protein  25.98 
 
 		 148 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  0.32074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4226  azurin  32.58 
 
 		 152 aa  46.2  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.151542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0546  azurin precursor  25.6 
 
 		 148 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.148254  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0658  azurin  32.18 
 
 		 149 aa  45.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453216 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  28.95 
 
 		 125 aa  44.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  24 
 
 		 160 aa  44.7  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65000  azurin precursor  29.07 
 
 		 148 aa  43.9  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>