42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0336 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0336  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1039    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1171  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  55.6 
 
 		 491 aa  580  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1580  large, multifunctional secreted protein  34.82 
 
 		 506 aa  305  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.10938  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  37.09 
 
 		 673 aa  299  8e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  35.24 
 
 		 722 aa  296  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3236  cytochrome c class I  36.72 
 
 		 647 aa  296  8e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0631004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  35.74 
 
 		 669 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4773  cytochrome c class I  32.78 
 
 		 669 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2205  cytochrome c class I  34.26 
 
 		 656 aa  263  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6271  cytochrome c class I  34.59 
 
 		 663 aa  259  8e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000987167  normal  0.709184 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1439  hypothetical protein  32.38 
 
 		 509 aa  259  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.421301  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5004  hypothetical protein  27.29 
 
 		 1010 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5289  cytochrome c class I  24.62 
 
 		 920 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.93 
 
 		 1162 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.76 
 
 		 1149 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  31.06 
 
 		 1110 aa  58.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36 
 
 		 1306 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.86 
 
 		 1027 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  23.66 
 
 		 1143 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  24.1 
 
 		 1141 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3063  NHL repeat containing protein  24.23 
 
 		 488 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 		 448 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  27.49 
 
 		 1139 aa  47  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  25.08 
 
 		 546 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.64 
 
 		 487 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454131  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  23.19 
 
 		 363 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000245782  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.44 
 
 		 1265 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2444  hypothetical protein  29.13 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5485  cytochrome c class I  24.35 
 
 		 561 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.233629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.89 
 
 		 1180 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  25.67 
 
 		 446 aa  44.3  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.6 
 
 		 1274 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  27.47 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  27.47 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2640  putative L-sorbosone dehydrogenase  26.74 
 
 		 451 aa  43.9  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4119  L-sorbosone dehydrogenase  23.78 
 
 		 448 aa  43.9  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2420  L-sorbosone dehydrogenase  25.51 
 
 		 461 aa  43.9  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.840322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.86 
 
 		 448 aa  43.5  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  26.74 
 
 		 430 aa  43.5  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  25.53 
 
 		 430 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2141  hypothetical protein  27.56 
 
 		 346 aa  43.5  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.02 
 
 		 1055 aa  43.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>