36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2141 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2141  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  704    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  30.05 
 
 		 664 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1165  NHL repeat containing protein  27.86 
 
 		 950 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0259008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  26.05 
 
 		 439 aa  53.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.05 
 
 		 307 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  26.2 
 
 		 646 aa  52.8  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  25.74 
 
 		 460 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  25.12 
 
 		 363 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000245782  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.29 
 
 		 1130 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  26.62 
 
 		 307 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  31.32 
 
 		 1026 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  27.14 
 
 		 502 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1418  hypothetical protein  36.7 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.663029  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  24.09 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.61 
 
 		 693 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1014  NHL repeat containing protein  27.27 
 
 		 444 aa  47.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00195026  normal  0.319723 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3880  hypothetical protein  31.07 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4789  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.78 
 
 		 550 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4408  NHL repeat-containing protein  27.78 
 
 		 538 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4495  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.78 
 
 		 538 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.06 
 
 		 1292 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  25.84 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.7 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  27.01 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1030 aa  44.3  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  22.33 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3939  NHL repeat-containing protein  27.66 
 
 		 454 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0801194 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.75 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  28.8 
 
 		 1140 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3565  hypothetical protein  22.73 
 
 		 791 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0336  hypothetical protein  27.56 
 
 		 502 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  24.32 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  26.01 
 
 		 963 aa  42.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  24.14 
 
 		 807 aa  42.7  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42680  hypothetical protein  24.17 
 
 		 289 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2800  NHL repeat-containing protein  27.35 
 
 		 538 aa  42.7  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350365  normal  0.74213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>