22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1014 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1014  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 444 aa  873    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00195026  normal  0.319723 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3939  NHL repeat-containing protein  32.38 
 
 		 454 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0801194 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1165  NHL repeat containing protein  30.83 
 
 		 950 aa  130  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0259008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  28.74 
 
 		 664 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  21.33 
 
 		 927 aa  51.2  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  28 
 
 		 831 aa  50.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3598  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1501 aa  48.5  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  26.11 
 
 		 1351 aa  47.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  25.56 
 
 		 302 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2141  hypothetical protein  27.27 
 
 		 346 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0841  NHL repeat containing protein  29.55 
 
 		 621 aa  47.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0416  hypothetical protein  31.09 
 
 		 673 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0810829 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  26.81 
 
 		 1750 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1696  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.29 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  28.71 
 
 		 1030 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  25.81 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3600  hypothetical protein  31.3 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  32.94 
 
 		 1232 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  32.43 
 
 		 1140 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.23 
 
 		 343 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  27.57 
 
 		 294 aa  43.5  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  23.61 
 
 		 963 aa  43.1  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>