82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7528 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  100 
 
 		 302 aa  587  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  65.64 
 
 		 299 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  63.01 
 
 		 291 aa  361  7.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  57.14 
 
 		 294 aa  309  5e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  51.19 
 
 		 296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  54.45 
 
 		 285 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3844  hydrolase  50.54 
 
 		 280 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0281491 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3932  hydrolase  50.18 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3858  hydrolase  50.18 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  43.15 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  47.64 
 
 		 290 aa  238  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5817  hypothetical protein  65 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3155  putative antibiotic hydrolase signal peptide protein  33.79 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5035  NHL repeat containing protein  34.31 
 
 		 455 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0114728  decreased coverage  0.00343119 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  30.42 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  25.66 
 
 		 335 aa  93.6  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1421  streptogramin lyase  29.58 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  28.44 
 
 		 416 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  28.98 
 
 		 927 aa  88.2  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  28.57 
 
 		 326 aa  86.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1989  streptogramin lyase gluconolactonase family  28.74 
 
 		 368 aa  85.9  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.16 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  33.81 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  23.9 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  27.17 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  32.32 
 
 		 1009 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  30.8 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  29.66 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2738  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  25.91 
 
 		 772 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  23.95 
 
 		 1750 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  28.27 
 
 		 770 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.11 
 
 		 693 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  22.96 
 
 		 892 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1671  hypothetical protein  22.06 
 
 		 524 aa  59.3  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  22.74 
 
 		 863 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  23.9 
 
 		 841 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3511  hypothetical protein  27.23 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.621558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.48 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4789  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.19 
 
 		 550 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  24.51 
 
 		 732 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4408  NHL repeat-containing protein  27.19 
 
 		 538 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4495  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.19 
 
 		 538 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  26.09 
 
 		 627 aa  53.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  22.44 
 
 		 1293 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.25 
 
 		 334 aa  52.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1199  hypothetical protein  22.82 
 
 		 533 aa  51.2  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  25.61 
 
 		 657 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  25.61 
 
 		 657 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  25.61 
 
 		 657 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  25.61 
 
 		 657 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  25.61 
 
 		 657 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  25.61 
 
 		 657 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  25.99 
 
 		 805 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  25 
 
 		 657 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  26.88 
 
 		 664 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4964  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.45 
 
 		 529 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  21.88 
 
 		 1351 aa  49.7  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3693  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.5 
 
 		 531 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0345166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  22.73 
 
 		 668 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  25.96 
 
 		 719 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  22.83 
 
 		 522 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.82 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1014  NHL repeat containing protein  25.56 
 
 		 444 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00195026  normal  0.319723 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  22.49 
 
 		 1130 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 1026 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  22.94 
 
 		 1292 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  26.16 
 
 		 667 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  23.74 
 
 		 963 aa  46.2  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  23.85 
 
 		 439 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  25.86 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  23.19 
 
 		 502 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0908  gluconolactonase  24.68 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.17943 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  28.57 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.74 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  20.77 
 
 		 807 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  24.82 
 
 		 1991 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.39 
 
 		 406 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  30.84 
 
 		 709 aa  42.7  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  22.31 
 
 		 2296 aa  42.7  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  26.36 
 
 		 525 aa  42.7  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1608 aa  42.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>