70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1989 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1989  streptogramin lyase gluconolactonase family  100 
 
 		 368 aa  749    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  55.12 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  49.68 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1421  streptogramin lyase  49.67 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  40.19 
 
 		 416 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.1 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  32.85 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  28.19 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  29.51 
 
 		 331 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2738  twin-arginine translocation pathway signal  31.2 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  29.58 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  30 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  29.88 
 
 		 316 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3155  putative antibiotic hydrolase signal peptide protein  26.86 
 
 		 392 aa  86.3  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  28.74 
 
 		 302 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  27.63 
 
 		 657 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  27.24 
 
 		 657 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  27.24 
 
 		 657 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  27.24 
 
 		 657 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  27.24 
 
 		 657 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  27.24 
 
 		 657 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  27.24 
 
 		 657 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  29.22 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  26.04 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  27.13 
 
 		 667 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  30.23 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  27.41 
 
 		 927 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  25.42 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  28.57 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3932  hydrolase  27.09 
 
 		 280 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3858  hydrolase  27.09 
 
 		 280 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3844  hydrolase  27.09 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0281491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  23.98 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  26.75 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1671  hypothetical protein  23.83 
 
 		 524 aa  62.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.21 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1949 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5817  hypothetical protein  30.07 
 
 		 272 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0329  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.97 
 
 		 553 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  27.63 
 
 		 457 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.16 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2583  hypothetical protein  28.11 
 
 		 312 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.1 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.51 
 
 		 406 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  25.64 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  22.45 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0604  hypothetical protein  26.7 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1199  hypothetical protein  21.75 
 
 		 533 aa  47.4  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  28.97 
 
 		 314 aa  46.6  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  21.24 
 
 		 1557 aa  46.2  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.74 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.66 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.19 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1667 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.57 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.67 
 
 		 521 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  28.39 
 
 		 1009 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.18 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  24.22 
 
 		 810 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  27.1 
 
 		 776 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.55 
 
 		 522 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.71 
 
 		 336 aa  43.5  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.3 
 
 		 326 aa  43.5  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  26.58 
 
 		 479 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.08 
 
 		 517 aa  42.7  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.16 
 
 		 279 aa  42.7  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.25 
 
 		 377 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.14 
 
 		 329 aa  42.7  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3908  periplasmic ligand-binding sensor protein  23.2 
 
 		 386 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.83 
 
 		 328 aa  42.7  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>