33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5817 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5817  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  531  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  64.6 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  62.73 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  59.01 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  56.21 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  47.13 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  48.26 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  46.58 
 
 		 294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3858  hydrolase  52.98 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3844  hydrolase  52.98 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0281491 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3932  hydrolase  52.98 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  44.03 
 
 		 377 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  31.43 
 
 		 416 aa  65.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  31.54 
 
 		 326 aa  62  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  29.8 
 
 		 927 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1421  streptogramin lyase  31.43 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3155  putative antibiotic hydrolase signal peptide protein  33.9 
 
 		 392 aa  53.9  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1989  streptogramin lyase gluconolactonase family  30.07 
 
 		 368 aa  52.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  32.43 
 
 		 331 aa  52.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  32.31 
 
 		 349 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  26.06 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1009 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  26.04 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  28.26 
 
 		 657 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  28.26 
 
 		 657 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  28.26 
 
 		 657 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  28.26 
 
 		 657 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  28.26 
 
 		 657 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.25 
 
 		 351 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  27.54 
 
 		 657 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  27.54 
 
 		 657 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  36.89 
 
 		 328 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3511  hypothetical protein  29.71 
 
 		 408 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.621558  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>