61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1889 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  100 
 
 
290 aa  564  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  51.07 
 
 
299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  47.64 
 
 
302 aa  238  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3932  hydrolase  46.89 
 
 
280 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3858  hydrolase  46.89 
 
 
280 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3844  hydrolase  46.89 
 
 
280 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0281491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  44.71 
 
 
291 aa  221  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  45.96 
 
 
285 aa  218  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  46.18 
 
 
294 aa  215  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  38.77 
 
 
296 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5817  hypothetical protein  56.21 
 
 
272 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  32.1 
 
 
377 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3155  putative antibiotic hydrolase signal peptide protein  29.14 
 
 
392 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  33 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1421  streptogramin lyase  29.63 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1989  streptogramin lyase gluconolactonase family  29.22 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  33.6 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  26.47 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  22.73 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.84 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  26.83 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  29.23 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  28.2 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  26.18 
 
 
927 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5035  NHL repeat containing protein  29.17 
 
 
455 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0114728  decreased coverage  0.00343119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  28.63 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  29.46 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  23.65 
 
 
1608 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.52 
 
 
406 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1671  hypothetical protein  22.92 
 
 
524 aa  52.4  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  32.24 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2738  twin-arginine translocation pathway signal  30.4 
 
 
359 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.11 
 
 
1949 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0329  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.56 
 
 
553 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  24.1 
 
 
580 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  26.61 
 
 
1557 aa  49.3  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  24.66 
 
 
892 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  23.47 
 
 
657 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  23.47 
 
 
657 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  23.47 
 
 
657 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  23.47 
 
 
657 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  23.47 
 
 
657 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  23.47 
 
 
657 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  23.1 
 
 
657 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  23.74 
 
 
667 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.41 
 
 
689 aa  46.2  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  26.22 
 
 
1009 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3511  hypothetical protein  36.71 
 
 
408 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.621558  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0604  hypothetical protein  27.89 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.25 
 
 
607 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  26.83 
 
 
770 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4276  NHL repeat-containing protein  30 
 
 
543 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0287557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  22.56 
 
 
1682 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.32 
 
 
517 aa  42.7  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.5 
 
 
354 aa  42.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.53 
 
 
328 aa  42.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0841  NHL repeat containing protein  27.5 
 
 
621 aa  42.7  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  23.56 
 
 
819 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1199  hypothetical protein  23.81 
 
 
533 aa  42.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1568  strictosidine synthase  31.09 
 
 
327 aa  42.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.47 
 
 
328 aa  42.4  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>