80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3276 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  100 
 
 		 377 aa  756    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  43.15 
 
 		 302 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  41.58 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  40.07 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  42.09 
 
 		 291 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  37.69 
 
 		 294 aa  186  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  39.25 
 
 		 285 aa  159  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3844  hydrolase  37 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0281491 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3932  hydrolase  37 
 
 		 280 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3858  hydrolase  37 
 
 		 280 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  32.1 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5817  hypothetical protein  45.74 
 
 		 272 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5035  NHL repeat containing protein  29.43 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0114728  decreased coverage  0.00343119 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3155  putative antibiotic hydrolase signal peptide protein  27.41 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  29.72 
 
 		 416 aa  89.7  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  25.25 
 
 		 335 aa  86.7  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  27.09 
 
 		 328 aa  86.3  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  28.42 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  26.59 
 
 		 927 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1421  streptogramin lyase  27.84 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.6 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1009 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1989  streptogramin lyase gluconolactonase family  23.98 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  23.01 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  24.69 
 
 		 732 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  25.2 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  23.64 
 
 		 841 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  25.79 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1199  hypothetical protein  25.43 
 
 		 533 aa  58.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  19.68 
 
 		 1293 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1671  hypothetical protein  23.81 
 
 		 524 aa  57.8  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2738  twin-arginine translocation pathway signal  30.2 
 
 		 359 aa  57  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  22.02 
 
 		 770 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3511  hypothetical protein  25 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.621558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  28.57 
 
 		 316 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  23.67 
 
 		 930 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  22.07 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.3 
 
 		 1130 aa  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  24.22 
 
 		 657 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1667 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  22.55 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  22.91 
 
 		 831 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  27.35 
 
 		 580 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  29.77 
 
 		 657 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  23.04 
 
 		 772 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  29.77 
 
 		 657 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  29.77 
 
 		 657 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  29.77 
 
 		 657 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  29.77 
 
 		 657 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.31 
 
 		 366 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  29.01 
 
 		 667 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  22.48 
 
 		 1750 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  27.35 
 
 		 819 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  26.58 
 
 		 668 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  29.23 
 
 		 657 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3693  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.13 
 
 		 531 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0345166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.74 
 
 		 279 aa  46.6  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  22.45 
 
 		 623 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.23 
 
 		 689 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  24.77 
 
 		 627 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1051 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3533  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.7 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.61 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  24.38 
 
 		 850 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.1 
 
 		 343 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  27.16 
 
 		 332 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  29.78 
 
 		 971 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.02 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  21.79 
 
 		 318 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.02 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.02 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  24.24 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4866  NHL repeat containing protein  24.6 
 
 		 510 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  24.77 
 
 		 719 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  24 
 
 		 1094 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.63 
 
 		 607 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  22.44 
 
 		 579 aa  43.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  22.27 
 
 		 1351 aa  43.1  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.02 
 
 		 377 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.33 
 
 		 348 aa  42.7  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>