More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4088 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 850 aa  1605    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  48.33 
 
 		 1351 aa  293  8e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  48.13 
 
 		 1030 aa  282  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  47.62 
 
 		 1750 aa  264  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  52.28 
 
 		 892 aa  244  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  46.24 
 
 		 772 aa  239  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.36 
 
 		 737 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  41.32 
 
 		 863 aa  233  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  45.27 
 
 		 1763 aa  220  7.999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6773  serine/threonine protein kinase  44.28 
 
 		 518 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.05 
 
 		 716 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4910  serine/threonine protein kinase  38.32 
 
 		 552 aa  197  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104206  decreased coverage  0.00224255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  46.46 
 
 		 623 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  50.21 
 
 		 807 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1051 aa  187  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  40.12 
 
 		 2831 aa  187  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  45.38 
 
 		 756 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.07 
 
 		 682 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  36.81 
 
 		 963 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  36.24 
 
 		 2296 aa  180  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  37.69 
 
 		 439 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0242  serine/threonine protein kinase  43.05 
 
 		 295 aa  174  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  41.35 
 
 		 719 aa  173  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  41.33 
 
 		 732 aa  173  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  38.05 
 
 		 1026 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  36.25 
 
 		 646 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  39.02 
 
 		 770 aa  161  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  35.03 
 
 		 425 aa  155  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  31 
 
 		 930 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.08 
 
 		 693 aa  150  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  32 
 
 		 831 aa  150  9e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  35.56 
 
 		 1130 aa  150  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  28.31 
 
 		 664 aa  147  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  37.31 
 
 		 1079 aa  145  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  37.74 
 
 		 2961 aa  143  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  31.29 
 
 		 346 aa  142  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  40.85 
 
 		 1046 aa  141  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  31.63 
 
 		 676 aa  140  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.98 
 
 		 1292 aa  131  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  33.21 
 
 		 579 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  35.57 
 
 		 2350 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  29.76 
 
 		 668 aa  129  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  36 
 
 		 763 aa  128  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1104  serine/threonine protein kinase  40.99 
 
 		 607 aa  126  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.511251  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  30 
 
 		 387 aa  126  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  29.25 
 
 		 627 aa  127  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  28.57 
 
 		 390 aa  125  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  38.25 
 
 		 618 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  35.05 
 
 		 612 aa  124  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 		 612 aa  124  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.81 
 
 		 584 aa  124  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  38.46 
 
 		 626 aa  124  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 		 666 aa  124  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  30.33 
 
 		 448 aa  124  8e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2229  protein kinase  44.39 
 
 		 500 aa  124  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.681599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  35.16 
 
 		 457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1202  serine/threonine protein kinase  34.21 
 
 		 655 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101789  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  32.26 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0382  serine/threonine protein kinase  39.09 
 
 		 583 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  38.53 
 
 		 599 aa  122  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.71 
 
 		 632 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  36.93 
 
 		 671 aa  120  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0422  serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 		 600 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709913  normal  0.835899 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  29.27 
 
 		 709 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  34.56 
 
 		 450 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7672  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.82 
 
 		 650 aa  120  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  29.36 
 
 		 752 aa  119  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  38.61 
 
 		 596 aa  119  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  32.27 
 
 		 571 aa  119  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1404  serine/threonine protein kinase  41.56 
 
 		 716 aa  119  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  32.57 
 
 		 1032 aa  118  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0027  serine/threonine protein kinase  40.58 
 
 		 473 aa  118  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  29.66 
 
 		 656 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.02 
 
 		 518 aa  117  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  32.57 
 
 		 1032 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 		 559 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  34.23 
 
 		 1916 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0112  protein kinase  39 
 
 		 469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 		 894 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1133  serine/threonine protein kinase  41.26 
 
 		 650 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  27.42 
 
 		 664 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.07 
 
 		 627 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  27.42 
 
 		 664 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 		 657 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 		 657 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 		 657 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3381  serine/threonine protein kinase  38.61 
 
 		 289 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 		 657 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  37.44 
 
 		 468 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 		 657 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  36.76 
 
 		 520 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 		 657 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  39.73 
 
 		 623 aa  116  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.02 
 
 		 668 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  30.67 
 
 		 614 aa  115  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  34.74 
 
 		 951 aa  115  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  34.15 
 
 		 1057 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1202  serine/threonine protein kinase  40.38 
 
 		 695 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0753061  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.64 
 
 		 700 aa  115  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  39.62 
 
 		 581 aa  115  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>