223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2369 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 579 aa  1160    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  54.59 
 
 		 831 aa  580  1e-164  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  40.46 
 
 		 522 aa  371  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  55.31 
 
 		 676 aa  343  5.999999999999999e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  58.33 
 
 		 930 aa  343  5.999999999999999e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  51.14 
 
 		 346 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  48.57 
 
 		 627 aa  302  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  51.01 
 
 		 668 aa  301  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  47.29 
 
 		 387 aa  289  8e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  49.4 
 
 		 390 aa  282  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  46.88 
 
 		 930 aa  280  5e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  48.62 
 
 		 709 aa  276  6e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  48.84 
 
 		 343 aa  270  5e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  37.32 
 
 		 752 aa  269  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  43.4 
 
 		 1293 aa  260  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  41.54 
 
 		 391 aa  238  3e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  43.49 
 
 		 491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  37.88 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  41.79 
 
 		 588 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  42.9 
 
 		 786 aa  198  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  32.49 
 
 		 525 aa  177  4e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  35.14 
 
 		 1146 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  35.03 
 
 		 1079 aa  167  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  35.43 
 
 		 1163 aa  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  36.7 
 
 		 353 aa  159  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  34.75 
 
 		 319 aa  154  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  30.41 
 
 		 1068 aa  150  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  34.88 
 
 		 1030 aa  143  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  32.33 
 
 		 354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  33.56 
 
 		 1140 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  34.44 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  30.11 
 
 		 343 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  39.2 
 
 		 2296 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  34.73 
 
 		 1026 aa  136  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  35.69 
 
 		 343 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  31.98 
 
 		 1750 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  31.96 
 
 		 1177 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1030 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  32.23 
 
 		 646 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  32.49 
 
 		 850 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  35.05 
 
 		 963 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  31.65 
 
 		 355 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  33.43 
 
 		 1351 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  28.14 
 
 		 307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  29.35 
 
 		 355 aa  128  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  27.79 
 
 		 903 aa  128  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  33.83 
 
 		 888 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 359 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  31.02 
 
 		 365 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  39.26 
 
 		 561 aa  125  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  32.55 
 
 		 1051 aa  123  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  32.38 
 
 		 368 aa  121  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.82 
 
 		 1292 aa  121  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  28.87 
 
 		 363 aa  120  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  30.32 
 
 		 360 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  67.53 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  30.08 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  28 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  31.37 
 
 		 892 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  30.61 
 
 		 321 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  31.83 
 
 		 322 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  72.86 
 
 		 581 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  30.3 
 
 		 404 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  66.67 
 
 		 787 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  77.78 
 
 		 522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  67.11 
 
 		 735 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  72.06 
 
 		 958 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  72.86 
 
 		 294 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  29.54 
 
 		 361 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  62.07 
 
 		 919 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  68.42 
 
 		 627 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  59.57 
 
 		 298 aa  111  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  66.67 
 
 		 749 aa  111  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  71.43 
 
 		 848 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  61.73 
 
 		 479 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  29.43 
 
 		 373 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  28.95 
 
 		 639 aa  110  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  54.26 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  32.33 
 
 		 898 aa  108  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  60 
 
 		 869 aa  107  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  30.9 
 
 		 447 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  29.54 
 
 		 405 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  29.7 
 
 		 899 aa  103  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  29.24 
 
 		 906 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  27.86 
 
 		 772 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  32.07 
 
 		 315 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  63.38 
 
 		 1056 aa  101  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  27.83 
 
 		 323 aa  101  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  37.23 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  61.43 
 
 		 739 aa  100  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  36.21 
 
 		 396 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  67.65 
 
 		 361 aa  100  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  28.42 
 
 		 318 aa  100  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  30.22 
 
 		 395 aa  99.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  39.49 
 
 		 468 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  35.82 
 
 		 664 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  28.21 
 
 		 318 aa  99.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.17 
 
 		 693 aa  99  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  26.2 
 
 		 700 aa  98.2  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  56.79 
 
 		 110 aa  98.2  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.352852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>