266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1345 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  58.45 
 
 		 668 aa  741    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 676 aa  1347    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  56.74 
 
 		 930 aa  640    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  52.87 
 
 		 831 aa  601  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  46.21 
 
 		 1293 aa  444  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  41.51 
 
 		 588 aa  444  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  53.47 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  57.39 
 
 		 579 aa  335  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  59.12 
 
 		 346 aa  320  6e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  40.59 
 
 		 522 aa  319  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  51.74 
 
 		 390 aa  316  9e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  50 
 
 		 343 aa  312  1e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  57.23 
 
 		 930 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  49.01 
 
 		 627 aa  295  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  54.27 
 
 		 709 aa  293  6e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  46.54 
 
 		 391 aa  291  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  47.06 
 
 		 752 aa  265  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  44.44 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  44.07 
 
 		 491 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.36 
 
 		 1750 aa  230  8e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  31.26 
 
 		 963 aa  226  9e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  31.36 
 
 		 1030 aa  224  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.15 
 
 		 1292 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  30.58 
 
 		 1026 aa  214  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1068 aa  197  7e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  41.98 
 
 		 786 aa  188  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  38.41 
 
 		 525 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.34 
 
 		 1130 aa  184  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 1230 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  29.48 
 
 		 652 aa  161  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  35.07 
 
 		 319 aa  161  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  38.01 
 
 		 1079 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  35.74 
 
 		 353 aa  160  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  35.56 
 
 		 1163 aa  158  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  36.03 
 
 		 1146 aa  156  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  33.79 
 
 		 1030 aa  151  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  34.22 
 
 		 439 aa  151  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  32.79 
 
 		 307 aa  151  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  33.72 
 
 		 646 aa  150  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  34.76 
 
 		 903 aa  150  6e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  32.71 
 
 		 343 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  32.96 
 
 		 355 aa  144  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  36.39 
 
 		 2296 aa  143  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  33.33 
 
 		 1140 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  34.12 
 
 		 1051 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 		 850 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  31.06 
 
 		 354 aa  140  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  35.37 
 
 		 1351 aa  140  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  31.88 
 
 		 355 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  31.27 
 
 		 372 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  31.99 
 
 		 360 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  33.21 
 
 		 343 aa  137  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  32.1 
 
 		 359 aa  136  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  31.41 
 
 		 347 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  34.26 
 
 		 1177 aa  130  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  33.97 
 
 		 373 aa  130  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  31 
 
 		 365 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  31.77 
 
 		 888 aa  127  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  31.1 
 
 		 322 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  30.15 
 
 		 361 aa  125  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  28.68 
 
 		 363 aa  124  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  33.1 
 
 		 368 aa  124  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  32.58 
 
 		 899 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  63.53 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  36.59 
 
 		 447 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  30.11 
 
 		 321 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  62.65 
 
 		 488 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  38.89 
 
 		 664 aa  120  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  30.65 
 
 		 1763 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  69.44 
 
 		 749 aa  117  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  83.61 
 
 		 958 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  30.14 
 
 		 404 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  80.6 
 
 		 522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  31.02 
 
 		 898 aa  115  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  71.83 
 
 		 110 aa  115  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  70.59 
 
 		 848 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  75.36 
 
 		 581 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  28.04 
 
 		 318 aa  114  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  31.63 
 
 		 315 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  29.83 
 
 		 700 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  70.59 
 
 		 787 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  26.39 
 
 		 384 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  57.28 
 
 		 403 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  30.58 
 
 		 405 aa  111  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  32.01 
 
 		 906 aa  111  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  32.86 
 
 		 418 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  32.19 
 
 		 937 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  29.58 
 
 		 323 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  26.22 
 
 		 772 aa  108  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  73.44 
 
 		 561 aa  107  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  68.06 
 
 		 361 aa  107  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  32.6 
 
 		 395 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  28.83 
 
 		 1834 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  58.62 
 
 		 919 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  32.38 
 
 		 396 aa  105  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  32.08 
 
 		 412 aa  104  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  29.45 
 
 		 318 aa  104  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  69.57 
 
 		 735 aa  104  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  28.47 
 
 		 326 aa  104  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  68.12 
 
 		 294 aa  104  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>