121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3222 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 412 aa  832    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  48.84 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  44.92 
 
 		 395 aa  327  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  45.31 
 
 		 436 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  45.03 
 
 		 379 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  36.89 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  34.98 
 
 		 368 aa  163  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  31.48 
 
 		 353 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  31.76 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  27.54 
 
 		 363 aa  120  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  30.07 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  27.64 
 
 		 347 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  29.19 
 
 		 343 aa  116  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  29.32 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  26.11 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  29.35 
 
 		 930 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  29.79 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  28.62 
 
 		 668 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 627 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  28.53 
 
 		 360 aa  106  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  31.01 
 
 		 831 aa  106  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  28.22 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  32.08 
 
 		 676 aa  104  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  32.02 
 
 		 346 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  27.62 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  29.58 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  29.76 
 
 		 522 aa  99.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  30.31 
 
 		 1293 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  25.99 
 
 		 355 aa  97.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  29.8 
 
 		 588 aa  94  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  29.52 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  31.9 
 
 		 752 aa  94  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  32.26 
 
 		 525 aa  89.4  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  32.78 
 
 		 579 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.17 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  29.37 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  30.32 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  27.48 
 
 		 709 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  32.38 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  27.21 
 
 		 1177 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1163 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  29.19 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  30.72 
 
 		 930 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  30.81 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  29.36 
 
 		 1146 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  26.43 
 
 		 1030 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  28.21 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  27.69 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  22.51 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  26.64 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  27.48 
 
 		 786 aa  69.7  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  29.44 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  27.78 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  29.11 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  28.7 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  26.87 
 
 		 315 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  27.57 
 
 		 700 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 1230 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  29.44 
 
 		 888 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  32.39 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  31.69 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 		 683 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  24.41 
 
 		 639 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  26.97 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  28.64 
 
 		 930 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  28.37 
 
 		 841 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  27.33 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  31.91 
 
 		 898 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1591  NHL repeat containing protein  24.73 
 
 		 686 aa  58.9  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.24269  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  21.99 
 
 		 1068 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.75 
 
 		 1834 aa  56.6  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  30.06 
 
 		 937 aa  56.6  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  26.29 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0241  tetratricopeptide repeat domain protein  29.79 
 
 		 668 aa  56.2  0.0000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.113606  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  40.79 
 
 		 521 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  26.42 
 
 		 903 aa  55.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  28.08 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  30.05 
 
 		 447 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  28.79 
 
 		 684 aa  53.5  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  21.45 
 
 		 364 aa  53.9  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  26.2 
 
 		 1140 aa  53.1  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  24.86 
 
 		 1079 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  27.36 
 
 		 906 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2082  NHL repeat containing protein  26.96 
 
 		 660 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  20.5 
 
 		 1030 aa  51.6  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5916  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205268  normal  0.0756085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0086  NHL repeat-containing protein  26.62 
 
 		 680 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0291  NHL repeat-containing protein  31.05 
 
 		 669 aa  50.4  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1026 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.41 
 
 		 693 aa  50.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  22.98 
 
 		 1750 aa  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  28.37 
 
 		 899 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  24.38 
 
 		 2296 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  25.19 
 
 		 963 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  22.3 
 
 		 1351 aa  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  25.19 
 
 		 850 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.67 
 
 		 1130 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  32.22 
 
 		 359 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  25 
 
 		 913 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>