152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2137 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  663    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  79.19 
 
 		 321 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  70.62 
 
 		 326 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  60.94 
 
 		 328 aa  418  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  61.68 
 
 		 323 aa  418  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  60.62 
 
 		 318 aa  411  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  37.43 
 
 		 318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  34.03 
 
 		 284 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  32.93 
 
 		 831 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  30.58 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  32.23 
 
 		 668 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  32.5 
 
 		 930 aa  126  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  31.1 
 
 		 676 aa  125  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  32.4 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  30 
 
 		 364 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  31.83 
 
 		 579 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  30.63 
 
 		 522 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  30.71 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  34.21 
 
 		 211 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  31.1 
 
 		 627 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2067  NHL repeat containing protein  26.09 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  26.32 
 
 		 588 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.22 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  29.47 
 
 		 752 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  28.83 
 
 		 491 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  29.47 
 
 		 387 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  28.8 
 
 		 1293 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5916  NHL repeat-containing protein  30.96 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205268  normal  0.0756085 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  30.32 
 
 		 930 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  27.68 
 
 		 709 aa  98.6  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3780  hypothetical protein  28.31 
 
 		 377 aa  95.9  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  36.69 
 
 		 391 aa  95.9  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  29.05 
 
 		 390 aa  92.8  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  34.88 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  31.11 
 
 		 395 aa  89.7  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  25.63 
 
 		 1030 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  30.84 
 
 		 365 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  37.65 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  31.76 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4570  NHL repeat containing protein  25.56 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  31.4 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  32.07 
 
 		 1163 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  31.18 
 
 		 525 aa  82  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  33.75 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  32.07 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  31.1 
 
 		 1750 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  30.81 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  29.94 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  29.24 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  27.72 
 
 		 1140 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  32.56 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  28.1 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  28.9 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4420  NHL repeat containing protein  32.27 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1260  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.11 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.551998  hitchhiker  0.00024653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  29.89 
 
 		 1146 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  27.27 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  31.68 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1954  NHL repeat containing protein  27.7 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  26.69 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  28.21 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  25.53 
 
 		 786 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5930  NHL repeat containing protein  26.79 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  27.95 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  25 
 
 		 639 aa  72.4  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2082  NHL repeat containing protein  32.06 
 
 		 660 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  26.42 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0816  twin-arginine translocation pathway signal  24.92 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  34.15 
 
 		 1068 aa  69.3  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  26.8 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  27.54 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  26.52 
 
 		 1026 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  28.04 
 
 		 436 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1051 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.29 
 
 		 1292 aa  66.2  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  26.32 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  28.77 
 
 		 892 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.91 
 
 		 693 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15206  peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase-like protein  31.79 
 
 		 774 aa  64.3  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.002705  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  31.88 
 
 		 807 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  23.74 
 
 		 700 aa  64.3  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  25.49 
 
 		 646 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  29.69 
 
 		 963 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  28.5 
 
 		 2296 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  31.13 
 
 		 1130 aa  63.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  25.09 
 
 		 425 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1839  NHL repeat-containing protein  42.67 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.891916 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  27.37 
 
 		 888 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  27.08 
 
 		 719 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  29.02 
 
 		 1177 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  25.7 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  29.52 
 
 		 930 aa  59.7  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  26.07 
 
 		 805 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  27.23 
 
 		 841 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  25.42 
 
 		 747 aa  57.4  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 1230 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  30.6 
 
 		 684 aa  57  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  24.55 
 
 		 683 aa  57  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  22.9 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1988  hypothetical protein  23.29 
 
 		 322 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>