54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4570 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4570  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 353 aa  739    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5930  NHL repeat containing protein  49.86 
 
 		 367 aa  359  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0816  twin-arginine translocation pathway signal  41.99 
 
 		 414 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1962  peptidylglycine monooxygenase-like  42.44 
 
 		 375 aa  298  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1260  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.83 
 
 		 372 aa  290  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.551998  hitchhiker  0.00024653 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2067  NHL repeat containing protein  32.35 
 
 		 371 aa  152  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  29.51 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  29.32 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  25.24 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  26.13 
 
 		 326 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  27.04 
 
 		 321 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  25.62 
 
 		 284 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  25.56 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4420  NHL repeat containing protein  24.56 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1954  NHL repeat containing protein  28.27 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  23.2 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  27.69 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  26.09 
 
 		 522 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  26.57 
 
 		 668 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  25.12 
 
 		 676 aa  59.7  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  28.32 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  27.84 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  24.63 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  26.98 
 
 		 930 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  24.35 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  27.05 
 
 		 579 aa  56.2  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  31.79 
 
 		 709 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  36.47 
 
 		 930 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  31.4 
 
 		 1293 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  33.87 
 
 		 588 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  22.62 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  25.14 
 
 		 752 aa  53.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1030 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  32.28 
 
 		 360 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  29.37 
 
 		 831 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2082  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 660 aa  50.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  24.04 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  31.03 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  30.43 
 
 		 627 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  31.19 
 
 		 841 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  26.45 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  21.19 
 
 		 491 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.86 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  27.31 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  27.82 
 
 		 395 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  25.89 
 
 		 525 aa  46.2  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  25.26 
 
 		 379 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  25.13 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.74 
 
 		 1163 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  27.08 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1146 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  25.57 
 
 		 396 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  24.84 
 
 		 355 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  32.93 
 
 		 521 aa  43.1  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>