30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0816 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0816  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 414 aa  862    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1260  Type I secretion outer membrane protein, TolC  58.89 
 
 		 372 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.551998  hitchhiker  0.00024653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1962  peptidylglycine monooxygenase-like  58.81 
 
 		 375 aa  449  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4570  NHL repeat containing protein  43.79 
 
 		 353 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5930  NHL repeat containing protein  38.34 
 
 		 367 aa  256  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2067  NHL repeat containing protein  25.28 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  26.49 
 
 		 318 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  26.05 
 
 		 328 aa  87.4  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4420  NHL repeat containing protein  25.32 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  24.7 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  25.66 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1954  NHL repeat containing protein  23.4 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  24.92 
 
 		 322 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  24.55 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  23.6 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  28.37 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  25 
 
 		 627 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2082  NHL repeat containing protein  29.17 
 
 		 660 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  22.16 
 
 		 668 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  26 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  25.32 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  25.63 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  26.17 
 
 		 752 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5916  NHL repeat-containing protein  24.41 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205268  normal  0.0756085 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  25.75 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  25.13 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  31.4 
 
 		 211 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  20.78 
 
 		 676 aa  43.1  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3780  hypothetical protein  30.77 
 
 		 377 aa  43.1  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 379 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>