64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5916 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5916  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 379 aa  782    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205268  normal  0.0756085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3780  hypothetical protein  59.78 
 
 		 377 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  29.62 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  30.96 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  29.97 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  27.81 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  27.14 
 
 		 326 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  26.44 
 
 		 930 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  26.27 
 
 		 318 aa  87.4  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.42 
 
 		 343 aa  86.7  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  27.6 
 
 		 588 aa  84.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  27.16 
 
 		 831 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  31.93 
 
 		 627 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  25.96 
 
 		 676 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  28.21 
 
 		 579 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  28.17 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  26.91 
 
 		 668 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  28.12 
 
 		 522 aa  73.2  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  27.13 
 
 		 1293 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  28.97 
 
 		 930 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  26.12 
 
 		 752 aa  70.5  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  25.37 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  26.13 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  25.64 
 
 		 491 aa  67  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  28.28 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  28.35 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  26.78 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  25.09 
 
 		 709 aa  59.7  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  24.75 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  27.1 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  23.6 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1068 aa  57.4  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  28.45 
 
 		 391 aa  57  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  30.53 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  25.69 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  26.94 
 
 		 1146 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1163 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  25.54 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  26.18 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5930  NHL repeat containing protein  25.84 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  24.44 
 
 		 365 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  26.82 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  34.11 
 
 		 395 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  30 
 
 		 525 aa  50.1  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  30.3 
 
 		 211 aa  49.7  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  33.15 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  27.33 
 
 		 700 aa  48.5  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  23.47 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  28.45 
 
 		 279 aa  47  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  27.37 
 
 		 1079 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  24.34 
 
 		 1030 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  25 
 
 		 307 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0816  twin-arginine translocation pathway signal  24.41 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  29.76 
 
 		 1177 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0374  periplasmic ATP/GTP-binding protein  30.65 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  29.85 
 
 		 1026 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  24.18 
 
 		 786 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.84 
 
 		 1292 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0414  NHL repeat containing protein  25.28 
 
 		 803 aa  43.1  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316951  normal  0.387155 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  30 
 
 		 521 aa  43.1  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 1230 aa  43.1  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  22.56 
 
 		 360 aa  42.7  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>