104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4764 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  100 
 
 
284 aa  586  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  49.27 
 
 
279 aa  248  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  54.5 
 
 
211 aa  235  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  34.03 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  37.02 
 
 
323 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  33.61 
 
 
318 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  31.94 
 
 
328 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  28.97 
 
 
326 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  31.14 
 
 
321 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  35.81 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  28.32 
 
 
831 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  27.76 
 
 
930 aa  104  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  28.57 
 
 
1293 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  28.97 
 
 
364 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  28.85 
 
 
668 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  28.34 
 
 
346 aa  97.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  25.81 
 
 
676 aa  96.3  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  33.15 
 
 
627 aa  94  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  30.14 
 
 
588 aa  90.5  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5930  NHL repeat containing protein  30.77 
 
 
367 aa  89  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  28.83 
 
 
579 aa  88.2  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4570  NHL repeat containing protein  25.62 
 
 
353 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  31.47 
 
 
365 aa  85.9  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  27.27 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  29.38 
 
 
491 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  25.09 
 
 
522 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.27 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  28.51 
 
 
525 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  31.79 
 
 
709 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  23.95 
 
 
752 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  34.88 
 
 
418 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  26.01 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  31.5 
 
 
390 aa  79  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  29.82 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  31.69 
 
 
384 aa  77  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  33.78 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2067  NHL repeat containing protein  25 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  28.82 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  32.12 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  27.73 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  34.09 
 
 
930 aa  73.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  36.97 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1962  peptidylglycine monooxygenase-like  25.21 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  30.67 
 
 
1030 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  31.91 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  27.43 
 
 
639 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1954  NHL repeat containing protein  30.88 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15206  peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase-like protein  34.85 
 
 
774 aa  69.7  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.002705  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  27.01 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3780  hypothetical protein  27.76 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  25.63 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  31.2 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  27.85 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  25.37 
 
 
307 aa  67  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0816  twin-arginine translocation pathway signal  23.6 
 
 
414 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5916  NHL repeat-containing protein  28.35 
 
 
379 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205268  normal  0.0756085 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  33.33 
 
 
1068 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4420  NHL repeat containing protein  31.01 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  29.68 
 
 
899 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  35.65 
 
 
395 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  30 
 
 
396 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  26.06 
 
 
700 aa  63.2  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  25.48 
 
 
391 aa  62.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  28.1 
 
 
343 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  33.58 
 
 
373 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1260  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.96 
 
 
372 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.551998  hitchhiker  0.00024653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  26.5 
 
 
1146 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  25.62 
 
 
786 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  27.98 
 
 
898 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  27.33 
 
 
412 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  33.54 
 
 
359 aa  59.3  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  25.56 
 
 
684 aa  58.9  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  23.74 
 
 
903 aa  58.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  28.68 
 
 
888 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
1230 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  29 
 
 
354 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  25.49 
 
 
1163 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  27.23 
 
 
343 aa  55.8  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  27.96 
 
 
436 aa  55.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  23.66 
 
 
719 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2082  NHL repeat containing protein  28.04 
 
 
660 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  23.98 
 
 
361 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  27.46 
 
 
315 aa  52.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  30.53 
 
 
1079 aa  52.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  31.69 
 
 
678 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1997  NHL repeat-containing protein  25.16 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000426581  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  29.12 
 
 
841 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  36.84 
 
 
521 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  24.84 
 
 
1750 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  29.87 
 
 
1140 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  25.09 
 
 
439 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  27.78 
 
 
1834 aa  47  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2493  NHL repeat-containing protein  26.35 
 
 
260 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  22.37 
 
 
892 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  23.96 
 
 
315 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  30.71 
 
 
448 aa  46.6  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 
405 aa  46.2  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  40 
 
 
386 aa  46.2  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  25.6 
 
 
1351 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  24.87 
 
 
772 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>