104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3219 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  648    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  38.55 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  39.12 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  38.62 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  35.01 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  37.43 
 
 		 322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  37.38 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  35.81 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  34.07 
 
 		 279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  30.77 
 
 		 930 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  33.91 
 
 		 211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  30.34 
 
 		 364 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  29.41 
 
 		 668 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  29.45 
 
 		 676 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  28.67 
 
 		 831 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  29.66 
 
 		 346 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  29.41 
 
 		 387 aa  99.4  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  28.21 
 
 		 579 aa  99.4  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  31.53 
 
 		 1293 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  30.09 
 
 		 491 aa  97.1  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  29.18 
 
 		 627 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  34.05 
 
 		 709 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  34.55 
 
 		 522 aa  87  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.86 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  22.09 
 
 		 588 aa  83.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  31.02 
 
 		 1030 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  34.91 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  31.58 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5916  NHL repeat-containing protein  28.17 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205268  normal  0.0756085 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  32.14 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  25.77 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  29.09 
 
 		 930 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  34.24 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  29.03 
 
 		 752 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  28.86 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  30.45 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2067  NHL repeat containing protein  26.79 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  25.95 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  31 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1954  NHL repeat containing protein  28.05 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  26.25 
 
 		 396 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  28.7 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  30 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3780  hypothetical protein  26.3 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  27.6 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  25.82 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  28.85 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  28.57 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  27.32 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  28.98 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  24.27 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  24.72 
 
 		 1177 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5930  NHL repeat containing protein  24.47 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4420  NHL repeat containing protein  26.2 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1068 aa  60.1  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  28.04 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  24.89 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  25.91 
 
 		 395 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  30.85 
 
 		 1163 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1260  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.92 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.551998  hitchhiker  0.00024653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  22.27 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  28.24 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  35.77 
 
 		 359 aa  57  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  27.55 
 
 		 1140 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.4 
 
 		 693 aa  56.2  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  29.14 
 
 		 747 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0816  twin-arginine translocation pathway signal  28.37 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  25.34 
 
 		 1351 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  25.77 
 
 		 1146 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 		 772 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4570  NHL repeat containing protein  22.62 
 
 		 353 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  28.86 
 
 		 1750 aa  53.1  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  25.79 
 
 		 786 aa  53.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  27.81 
 
 		 841 aa  52.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  37.65 
 
 		 521 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  24.37 
 
 		 805 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 1230 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.37 
 
 		 1292 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  36.14 
 
 		 684 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15206  peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase-like protein  27.36 
 
 		 774 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.002705  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  25.17 
 
 		 700 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  28.25 
 
 		 664 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  24.61 
 
 		 439 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  25 
 
 		 639 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  24.74 
 
 		 360 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  26.82 
 
 		 903 aa  50.1  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  21.6 
 
 		 448 aa  50.1  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  25.42 
 
 		 711 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  27.39 
 
 		 719 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  26.42 
 
 		 899 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  21.6 
 
 		 1051 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  26.32 
 
 		 963 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  24.81 
 
 		 646 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  25.65 
 
 		 1026 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  23.38 
 
 		 892 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  22.99 
 
 		 425 aa  46.2  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  30.59 
 
 		 498 aa  45.8  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  26.36 
 
 		 930 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.84 
 
 		 1130 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  27.23 
 
 		 2296 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>