126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2878 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  731    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  30 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  29.81 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  30.34 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  26.67 
 
 		 326 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  32.32 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  29.24 
 
 		 668 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  28.97 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  31.28 
 
 		 831 aa  96.3  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  29.11 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  28.33 
 
 		 676 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  26.3 
 
 		 328 aa  93.6  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.91 
 
 		 343 aa  92.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  26.46 
 
 		 1293 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  22.91 
 
 		 588 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  24.92 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  32.45 
 
 		 930 aa  89  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  25.73 
 
 		 579 aa  86.7  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  31.08 
 
 		 279 aa  86.3  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  28.39 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  31.46 
 
 		 930 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  28.19 
 
 		 627 aa  82.8  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  25 
 
 		 752 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  27.89 
 
 		 522 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  25.3 
 
 		 391 aa  79.3  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  33.73 
 
 		 1163 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  31.66 
 
 		 1146 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  27.05 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  29.05 
 
 		 709 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  28.78 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  30.09 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  30.43 
 
 		 1030 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  27.23 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  41.18 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  33.11 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  26.56 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3780  hypothetical protein  27.56 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  25.71 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  24.89 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  30.6 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  29.8 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  23.84 
 
 		 639 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5930  NHL repeat containing protein  27.22 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  24.44 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  28.43 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1954  NHL repeat containing protein  31.03 
 
 		 340 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  32 
 
 		 1140 aa  66.2  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  29.38 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  26.77 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  22.14 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4570  NHL repeat containing protein  27.69 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  30.82 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  25.28 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  27.45 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15206  peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase-like protein  26.57 
 
 		 774 aa  62.8  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.002705  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  28.95 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.9 
 
 		 1292 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  24.59 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  30.41 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1068 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  27.14 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  27.33 
 
 		 786 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5916  NHL repeat-containing protein  27.1 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205268  normal  0.0756085 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  24.91 
 
 		 1750 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0086  NHL repeat-containing protein  30.49 
 
 		 680 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  26.38 
 
 		 684 aa  57  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  21.43 
 
 		 700 aa  57.4  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  27.87 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  30.24 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1030 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  29.31 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  26.63 
 
 		 899 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  23.08 
 
 		 343 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  28 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.76 
 
 		 693 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  24.5 
 
 		 888 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  32.45 
 
 		 898 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  30.82 
 
 		 937 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  27.16 
 
 		 732 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  21.17 
 
 		 412 aa  53.5  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  28.57 
 
 		 711 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1351 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  23.96 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  27.72 
 
 		 903 aa  51.6  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  27.47 
 
 		 623 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  24.59 
 
 		 447 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  22.75 
 
 		 436 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  37.23 
 
 		 913 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  32.39 
 
 		 2296 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 		 678 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  29.1 
 
 		 646 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2082  NHL repeat containing protein  30.16 
 
 		 660 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  32.5 
 
 		 343 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  30.66 
 
 		 1026 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  23.31 
 
 		 906 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  26.39 
 
 		 963 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.78 
 
 		 1834 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  26.82 
 
 		 747 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1260  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.89 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.551998  hitchhiker  0.00024653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4420  NHL repeat containing protein  30.88 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.249913 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>