58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1954 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1954  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 340 aa  663    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4420  NHL repeat containing protein  55.69 
 
 		 320 aa  314  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2067  NHL repeat containing protein  29.21 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  30.06 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5930  NHL repeat containing protein  25.71 
 
 		 367 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  28.01 
 
 		 326 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  27.7 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  25.58 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1962  peptidylglycine monooxygenase-like  24.38 
 
 		 375 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  27.19 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4570  NHL repeat containing protein  28.27 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  24.32 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1260  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.78 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.551998  hitchhiker  0.00024653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0816  twin-arginine translocation pathway signal  23.4 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  30.88 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  28.05 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  42.42 
 
 		 279 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  31.03 
 
 		 364 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  35.97 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  40.48 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  26.59 
 
 		 752 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  25.42 
 
 		 676 aa  59.7  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  25.33 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  26.94 
 
 		 668 aa  56.6  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  28.1 
 
 		 831 aa  56.6  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  31.65 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  30 
 
 		 522 aa  53.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  29.35 
 
 		 365 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  29.47 
 
 		 387 aa  53.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  23.91 
 
 		 700 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  32.79 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  24.22 
 
 		 930 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 391 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  27.92 
 
 		 711 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  27.27 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  24.59 
 
 		 355 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  32.52 
 
 		 930 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.43 
 
 		 1292 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  32.74 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  37.36 
 
 		 1030 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  27.42 
 
 		 579 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  38.64 
 
 		 396 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 491 aa  46.2  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.3 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  40.51 
 
 		 405 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  34.91 
 
 		 1177 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  28.29 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3780  hypothetical protein  24.93 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  30.26 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  28.09 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  29.19 
 
 		 627 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  26.79 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  28.08 
 
 		 1293 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  29.9 
 
 		 1146 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  32.94 
 
 		 709 aa  43.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  30.93 
 
 		 1163 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13808  predicted protein  24.63 
 
 		 1675 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0947447  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  27 
 
 		 359 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>