147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1920 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 343 aa  697    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  54.52 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  55.96 
 
 		 353 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  36.81 
 
 		 347 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  36.22 
 
 		 372 aa  209  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  35.65 
 
 		 355 aa  202  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  34.41 
 
 		 365 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  35.39 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  34.62 
 
 		 355 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  31.09 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  32.71 
 
 		 676 aa  149  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  31.66 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  30.41 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  28.16 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  31.82 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  31.02 
 
 		 930 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  31.29 
 
 		 668 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  29.34 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  30.11 
 
 		 579 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  28.62 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  30.42 
 
 		 831 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  30.58 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  28.22 
 
 		 359 aa  129  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  31.23 
 
 		 627 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  32.19 
 
 		 346 aa  126  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  31.76 
 
 		 412 aa  125  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  30.27 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  29.81 
 
 		 387 aa  119  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  30.19 
 
 		 709 aa  119  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  29.39 
 
 		 522 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  30.31 
 
 		 436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  29.51 
 
 		 390 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.8 
 
 		 343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  28.67 
 
 		 391 aa  109  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  28.35 
 
 		 752 aa  106  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  29.72 
 
 		 588 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  27.91 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  30.7 
 
 		 786 aa  99.4  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  26.46 
 
 		 930 aa  97.4  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  28.24 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1030 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  28.96 
 
 		 491 aa  96.7  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  28.51 
 
 		 392 aa  93.6  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  27.02 
 
 		 1293 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  29.95 
 
 		 525 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  26.52 
 
 		 386 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  26.78 
 
 		 906 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  27.98 
 
 		 1146 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.5 
 
 		 1163 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  26.13 
 
 		 899 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  25.96 
 
 		 1140 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  28.72 
 
 		 963 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  25.65 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  26.14 
 
 		 903 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  26.18 
 
 		 888 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  26.46 
 
 		 850 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  26.91 
 
 		 898 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.4 
 
 		 1292 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  22.85 
 
 		 1750 aa  72.8  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1997  NHL repeat-containing protein  24.44 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000426581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  25.32 
 
 		 913 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  24.26 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  25 
 
 		 639 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  26.42 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  20.93 
 
 		 1068 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  26.4 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  22.48 
 
 		 1351 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  25.6 
 
 		 1026 aa  69.7  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  24.19 
 
 		 700 aa  68.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1177 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  27.03 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.05 
 
 		 693 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  28.49 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  26.78 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1030 aa  63.2  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  25.61 
 
 		 2296 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  26.9 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  22.92 
 
 		 1079 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  26.9 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  23.6 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  23.61 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3066  NHL repeat-containing protein  22.87 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  22.92 
 
 		 732 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  27.64 
 
 		 930 aa  59.7  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  22.26 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  24.77 
 
 		 841 aa  59.3  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  26.82 
 
 		 646 aa  59.3  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  23.25 
 
 		 937 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 1230 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 678 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  22.27 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  22.46 
 
 		 1763 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3164  NHL repeat containing protein  23.32 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  28.89 
 
 		 711 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3259  NHL repeat containing protein  22.87 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  21.03 
 
 		 1834 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1126  NHL repeat containing protein  21.56 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.330169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.62 
 
 		 1130 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2493  NHL repeat-containing protein  21.12 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  23.72 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>