More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2630 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  100 
 
 		 930 aa  1858    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  56.78 
 
 		 676 aa  667    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  56.7 
 
 		 831 aa  648    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  54.94 
 
 		 668 aa  629  1e-178  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  42.08 
 
 		 588 aa  464  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  46.15 
 
 		 752 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  44.8 
 
 		 930 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  37.72 
 
 		 1293 aa  431  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  42.29 
 
 		 786 aa  354  5e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  58.33 
 
 		 579 aa  342  1e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  55.45 
 
 		 387 aa  336  1e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  54.14 
 
 		 346 aa  321  5e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  53.05 
 
 		 627 aa  313  1e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  52.88 
 
 		 709 aa  298  2e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  55.63 
 
 		 390 aa  293  9e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  58.16 
 
 		 343 aa  291  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  47.92 
 
 		 958 aa  285  4.0000000000000003e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  51.34 
 
 		 522 aa  281  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  41.62 
 
 		 491 aa  273  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  34.24 
 
 		 963 aa  267  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  46.21 
 
 		 392 aa  255  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.06 
 
 		 1750 aa  247  8e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  33.85 
 
 		 1094 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  53.91 
 
 		 963 aa  237  9e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  51.05 
 
 		 910 aa  234  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  44.55 
 
 		 869 aa  231  5e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1068 aa  226  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  41.23 
 
 		 391 aa  225  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  49.03 
 
 		 2036 aa  224  6e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  30.82 
 
 		 1030 aa  223  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  48.05 
 
 		 1682 aa  220  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  49.81 
 
 		 669 aa  219  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  48.46 
 
 		 581 aa  218  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  48.64 
 
 		 1300 aa  217  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  30.8 
 
 		 1026 aa  217  7e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  47.86 
 
 		 1969 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  45.55 
 
 		 1120 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  45.77 
 
 		 791 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  43.08 
 
 		 1241 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  47.86 
 
 		 1882 aa  215  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  44.48 
 
 		 547 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  43.46 
 
 		 2000 aa  213  9e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  47.06 
 
 		 679 aa  212  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  42.05 
 
 		 859 aa  213  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.16 
 
 		 1292 aa  209  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  46.69 
 
 		 685 aa  209  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  46.95 
 
 		 735 aa  208  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  46.3 
 
 		 713 aa  207  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  47.47 
 
 		 1842 aa  207  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  47.47 
 
 		 675 aa  207  8e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  48.35 
 
 		 3295 aa  204  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  44.17 
 
 		 561 aa  204  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  37.29 
 
 		 1862 aa  204  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  31.34 
 
 		 2554 aa  204  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  44.24 
 
 		 2272 aa  204  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  44.17 
 
 		 575 aa  204  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  45.72 
 
 		 941 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  46.09 
 
 		 2122 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  45.7 
 
 		 978 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  47.5 
 
 		 551 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  40.16 
 
 		 1667 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  45.51 
 
 		 1356 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  31.8 
 
 		 1667 aa  199  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  44.62 
 
 		 615 aa  198  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  45.62 
 
 		 1236 aa  197  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  46.69 
 
 		 658 aa  197  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.51 
 
 		 1130 aa  196  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  44.19 
 
 		 1732 aa  196  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  44.61 
 
 		 528 aa  195  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  31.92 
 
 		 1079 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  45.56 
 
 		 530 aa  188  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  42.66 
 
 		 1282 aa  187  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  39.93 
 
 		 525 aa  187  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  38.67 
 
 		 1361 aa  184  9.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  41.79 
 
 		 870 aa  180  8e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  44.9 
 
 		 823 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  36.45 
 
 		 1146 aa  176  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  54.94 
 
 		 1056 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  38 
 
 		 1163 aa  175  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  43.07 
 
 		 845 aa  174  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  42.26 
 
 		 840 aa  172  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  43.91 
 
 		 777 aa  171  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  35.79 
 
 		 319 aa  171  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  41.44 
 
 		 838 aa  170  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  42.01 
 
 		 861 aa  169  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  40.07 
 
 		 1783 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  37.38 
 
 		 2296 aa  165  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  44.66 
 
 		 460 aa  162  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  45.76 
 
 		 819 aa  162  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  35.66 
 
 		 307 aa  162  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  35.79 
 
 		 1140 aa  161  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  42.31 
 
 		 802 aa  160  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  38.04 
 
 		 1528 aa  160  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  29.58 
 
 		 652 aa  160  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  35.98 
 
 		 353 aa  157  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  34.05 
 
 		 1051 aa  156  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  43.44 
 
 		 2552 aa  154  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  33.13 
 
 		 646 aa  154  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 1230 aa  154  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  32.36 
 
 		 439 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>