134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3162 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 395 aa  807    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  56.4 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  45.36 
 
 		 412 aa  325  7e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  42.09 
 
 		 436 aa  289  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  40.11 
 
 		 379 aa  280  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  36.89 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  33.69 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  31.17 
 
 		 343 aa  136  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  31.6 
 
 		 353 aa  135  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  30.31 
 
 		 347 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  30.07 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  30.07 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  30.58 
 
 		 343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  31.51 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  30.26 
 
 		 361 aa  123  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  27.03 
 
 		 355 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  27.25 
 
 		 365 aa  119  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  27.36 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  28.85 
 
 		 930 aa  116  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  30.89 
 
 		 668 aa  112  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  31.86 
 
 		 346 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  27.96 
 
 		 831 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  32.16 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  32.6 
 
 		 676 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  23.89 
 
 		 418 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  30.22 
 
 		 579 aa  100  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  28.57 
 
 		 522 aa  99.8  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  27.46 
 
 		 359 aa  98.6  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  30.88 
 
 		 752 aa  97.1  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 391 aa  96.7  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  28.12 
 
 		 709 aa  95.5  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  28.77 
 
 		 491 aa  94.4  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  31.11 
 
 		 322 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  31.03 
 
 		 390 aa  89.7  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  27.94 
 
 		 525 aa  89  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  31.06 
 
 		 319 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  27.39 
 
 		 627 aa  87.8  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  24.66 
 
 		 588 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.39 
 
 		 343 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.33 
 
 		 1163 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  25.65 
 
 		 1293 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  29.73 
 
 		 321 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  32.98 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  26.23 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  28.64 
 
 		 1146 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  29.44 
 
 		 1030 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  26.46 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  31.84 
 
 		 639 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  30.37 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  27.91 
 
 		 1140 aa  73.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  40 
 
 		 521 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  28.57 
 
 		 930 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  24.89 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.2 
 
 		 1949 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  29.63 
 
 		 1177 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  27.92 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  27.17 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  24.63 
 
 		 700 aa  67  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  23.02 
 
 		 786 aa  66.6  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1068 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  24.14 
 
 		 307 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  24.91 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  28.42 
 
 		 1834 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  29.61 
 
 		 888 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  35.65 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  25.41 
 
 		 899 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  26.4 
 
 		 898 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  26.64 
 
 		 906 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  44.3 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 1230 aa  60.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  34.71 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  24.75 
 
 		 903 aa  59.3  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  25.91 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  31.63 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0241  tetratricopeptide repeat domain protein  30.18 
 
 		 668 aa  58.5  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.113606  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  30.41 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  25.89 
 
 		 913 aa  56.2  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1954  NHL repeat containing protein  31.65 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3066  NHL repeat-containing protein  25.9 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  32.95 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  23.19 
 
 		 850 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  27.37 
 
 		 937 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.5 
 
 		 693 aa  54.7  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  24.02 
 
 		 683 aa  53.9  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  24.22 
 
 		 1079 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  23.87 
 
 		 1750 aa  53.1  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.46 
 
 		 1292 aa  53.1  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0177  NHL repeat containing protein  29.89 
 
 		 716 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  24.57 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  24.71 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0086  NHL repeat-containing protein  32.95 
 
 		 680 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  28.02 
 
 		 747 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  26.77 
 
 		 841 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  27.65 
 
 		 1026 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  27.36 
 
 		 684 aa  50.8  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 678 aa  50.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  25.93 
 
 		 711 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5916  NHL repeat-containing protein  34.11 
 
 		 379 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205268  normal  0.0756085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  24.6 
 
 		 652 aa  50.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>