123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0742 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 355 aa  725    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  39.22 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  34.88 
 
 		 347 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  36.63 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  34.62 
 
 		 343 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  34.36 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  34.74 
 
 		 353 aa  182  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  36.68 
 
 		 372 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  35.31 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  32.36 
 
 		 363 aa  169  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  35.49 
 
 		 361 aa  169  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  35.59 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  33.55 
 
 		 368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  34.69 
 
 		 359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  31.88 
 
 		 676 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  32.82 
 
 		 386 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  31.97 
 
 		 831 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  31.7 
 
 		 930 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  30.77 
 
 		 668 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  30.94 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  29.35 
 
 		 579 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  34.6 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  27.03 
 
 		 395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  28.65 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  30.38 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  30.96 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  28.85 
 
 		 491 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  30.08 
 
 		 522 aa  109  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  29.23 
 
 		 752 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  31.3 
 
 		 588 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  29.36 
 
 		 1163 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  29.09 
 
 		 1146 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  29.43 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  29.84 
 
 		 379 aa  102  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  26.69 
 
 		 319 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  30.53 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  29.95 
 
 		 525 aa  99.4  8e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  29.48 
 
 		 627 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  25.99 
 
 		 412 aa  96.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  26.64 
 
 		 387 aa  96.7  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  29.81 
 
 		 1293 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  27.46 
 
 		 1030 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  28.95 
 
 		 709 aa  93.6  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  27.81 
 
 		 903 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.66 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  30 
 
 		 373 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  23.92 
 
 		 307 aa  89.7  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  27.11 
 
 		 786 aa  89  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  32.76 
 
 		 326 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  30.61 
 
 		 1140 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  26.6 
 
 		 1177 aa  86.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  27.1 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  25.93 
 
 		 913 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  27.15 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  28.23 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  28.32 
 
 		 700 aa  81.6  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  30.81 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  26.94 
 
 		 898 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  27.42 
 
 		 906 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  25.53 
 
 		 888 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  33.16 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  25.99 
 
 		 899 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  28.17 
 
 		 930 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  26.12 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 		 1230 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  30.11 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  28.19 
 
 		 937 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  29.94 
 
 		 639 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3066  NHL repeat-containing protein  25.58 
 
 		 297 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  25.63 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  29.31 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  27.38 
 
 		 504 aa  65.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  25.19 
 
 		 850 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3259  NHL repeat containing protein  24.65 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3164  NHL repeat containing protein  24.19 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  25.12 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  27.14 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1030 aa  59.7  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  23.5 
 
 		 1351 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  28.02 
 
 		 1026 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  22.46 
 
 		 1079 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  28.24 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  38.03 
 
 		 683 aa  56.6  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  23.41 
 
 		 678 aa  56.2  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  26.47 
 
 		 684 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  20.06 
 
 		 1750 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  27.06 
 
 		 211 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0241  tetratricopeptide repeat domain protein  25.62 
 
 		 668 aa  54.7  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.113606  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  29.89 
 
 		 315 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  26.98 
 
 		 581 aa  53.5  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  27.1 
 
 		 439 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  27.17 
 
 		 279 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1068 aa  53.1  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1997  NHL repeat-containing protein  26.86 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000426581  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  25.9 
 
 		 963 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.32 
 
 		 1834 aa  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  24.1 
 
 		 647 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  27.52 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  23.29 
 
 		 930 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1051 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>