79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3066 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3066  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 297 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3259  NHL repeat containing protein  90.57 
 
 		 297 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3164  NHL repeat containing protein  88.22 
 
 		 297 aa  528  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1126  NHL repeat containing protein  46.52 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.330169  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1997  NHL repeat-containing protein  45.26 
 
 		 303 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000426581  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2493  NHL repeat-containing protein  46.56 
 
 		 260 aa  235  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1838  NHL repeat-containing protein  48.34 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  29.3 
 
 		 930 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  28.95 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  26.1 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  28.42 
 
 		 522 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  28.32 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  28.09 
 
 		 676 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  26.24 
 
 		 831 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  27.39 
 
 		 1163 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  27.41 
 
 		 668 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  27.31 
 
 		 752 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  28.93 
 
 		 1293 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  26.59 
 
 		 579 aa  72.8  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  27.34 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  23.91 
 
 		 627 aa  70.9  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.14 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  29.56 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  25.58 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  26.23 
 
 		 1146 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  24.83 
 
 		 709 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  26.17 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  22.87 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  26.3 
 
 		 1177 aa  59.3  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  34.12 
 
 		 930 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  23.42 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  26.14 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  22.63 
 
 		 588 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  30.38 
 
 		 1140 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  27.85 
 
 		 888 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  24.47 
 
 		 639 aa  56.6  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  25.9 
 
 		 395 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  26.5 
 
 		 1079 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  29.07 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  30.83 
 
 		 1030 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  25.69 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  24.31 
 
 		 1750 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  26.79 
 
 		 359 aa  53.5  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  23.57 
 
 		 363 aa  52.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  22.43 
 
 		 360 aa  52.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  31.25 
 
 		 368 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  25.78 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 		 770 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 1230 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  31.33 
 
 		 439 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  25.95 
 
 		 786 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  24.65 
 
 		 343 aa  50.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  29.23 
 
 		 646 aa  49.3  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  27.33 
 
 		 447 aa  49.3  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  23.22 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  23.37 
 
 		 392 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  25 
 
 		 1351 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  28.63 
 
 		 418 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3441  hypothetical protein  34.94 
 
 		 422 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  21.67 
 
 		 448 aa  46.6  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  24.81 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1068 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  27.38 
 
 		 326 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  24.82 
 
 		 386 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  48.98 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2082  NHL repeat containing protein  25.45 
 
 		 660 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  25.09 
 
 		 732 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  29.13 
 
 		 405 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  24.53 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  24.51 
 
 		 664 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  25.56 
 
 		 365 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  26.6 
 
 		 436 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  40.85 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  26.27 
 
 		 361 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  27.14 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 384 aa  43.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  21.89 
 
 		 700 aa  42.7  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  25.88 
 
 		 347 aa  42.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  25.35 
 
 		 850 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>