25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1838 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1838  NHL repeat-containing protein  100 
 
 
296 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3259  NHL repeat containing protein  47.89 
 
 
297 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3164  NHL repeat containing protein  47.97 
 
 
297 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3066  NHL repeat-containing protein  48.34 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1997  NHL repeat-containing protein  41.64 
 
 
303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000426581  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2493  NHL repeat-containing protein  38.08 
 
 
260 aa  189  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1126  NHL repeat containing protein  37.68 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.330169  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  25.94 
 
 
347 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  21.53 
 
 
930 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  24.2 
 
 
831 aa  53.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  20.36 
 
 
676 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  25.32 
 
 
668 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  21.92 
 
 
346 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  27.61 
 
 
588 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  23.74 
 
 
579 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  23 
 
 
522 aa  46.2  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  25.71 
 
 
1293 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4125  NHL repeat-containing protein  28.04 
 
 
339 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.622365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  21.25 
 
 
627 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  22.3 
 
 
343 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 
1230 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28 
 
 
343 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  19.29 
 
 
372 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  28.95 
 
 
355 aa  42.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  27.43 
 
 
888 aa  42.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>