163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4124 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 359 aa  715    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  35.21 
 
 		 365 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  32.94 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  35.19 
 
 		 343 aa  176  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  31.01 
 
 		 360 aa  169  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  32.59 
 
 		 347 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  33.75 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  34.69 
 
 		 355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  32.61 
 
 		 354 aa  152  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  29.81 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  33.67 
 
 		 668 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  30.37 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  35.31 
 
 		 368 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  32.1 
 
 		 676 aa  136  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  33.99 
 
 		 353 aa  135  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  31.96 
 
 		 930 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  28.22 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  34.26 
 
 		 491 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  32.68 
 
 		 831 aa  126  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 579 aa  126  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  30.18 
 
 		 418 aa  122  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  31.3 
 
 		 346 aa  119  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  34.47 
 
 		 1293 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  33.6 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  30.12 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  29.36 
 
 		 396 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  33.02 
 
 		 522 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  30.71 
 
 		 709 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  31.68 
 
 		 391 aa  106  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  33.07 
 
 		 319 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  27.62 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  27.46 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.63 
 
 		 343 aa  96.3  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  28.57 
 
 		 752 aa  95.9  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  27.06 
 
 		 588 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  32.46 
 
 		 1030 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  27.99 
 
 		 1750 aa  93.2  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  26.57 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  30.39 
 
 		 1140 aa  90.1  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  32.12 
 
 		 405 aa  89.7  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  25.78 
 
 		 379 aa  89.7  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  29.13 
 
 		 627 aa  89  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  27.84 
 
 		 930 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  24.91 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  35.05 
 
 		 1146 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  27.91 
 
 		 525 aa  86.7  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  35.98 
 
 		 1163 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  30.53 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  27.67 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  29.9 
 
 		 937 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1030 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  30.23 
 
 		 786 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  28.51 
 
 		 899 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  27.05 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  26.47 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  27.46 
 
 		 1177 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  29.44 
 
 		 711 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  28.18 
 
 		 913 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  29.15 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  25.63 
 
 		 963 aa  72.8  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  27.37 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 		 850 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  33.72 
 
 		 639 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  31.28 
 
 		 1079 aa  69.7  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  33.02 
 
 		 664 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  26.99 
 
 		 700 aa  69.3  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  27.54 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  25 
 
 		 903 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  27.54 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  29.24 
 
 		 906 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 1230 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  30.65 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  27.16 
 
 		 684 aa  67.4  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  26.94 
 
 		 1834 aa  66.6  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.92 
 
 		 1292 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  24.02 
 
 		 1351 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1997  NHL repeat-containing protein  27.21 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000426581  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  28.99 
 
 		 747 aa  64.7  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  32.45 
 
 		 841 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  26.15 
 
 		 646 aa  63.5  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.81 
 
 		 693 aa  63.2  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1591  NHL repeat containing protein  34.31 
 
 		 686 aa  63.2  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.24269  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  25.86 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.27 
 
 		 1130 aa  60.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  30.59 
 
 		 683 aa  60.8  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  26.46 
 
 		 888 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  25.45 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  29.38 
 
 		 2296 aa  59.7  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0086  NHL repeat-containing protein  28.45 
 
 		 680 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  33.54 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  23.92 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  29.67 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5916  NHL repeat-containing protein  24.75 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205268  normal  0.0756085 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0890  hypothetical protein  29.47 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  31.67 
 
 		 1026 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  35.77 
 
 		 318 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  30.24 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  31.36 
 
 		 898 aa  55.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1051 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  25.38 
 
 		 807 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>