96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2296 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  100 
 
 		 684 aa  1382    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0241  tetratricopeptide repeat domain protein  27.33 
 
 		 668 aa  251  4e-65  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.113606  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  23.71 
 
 		 700 aa  200  6e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  30.17 
 
 		 668 aa  94  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  32.75 
 
 		 676 aa  91.3  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  28.52 
 
 		 930 aa  89  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  30.91 
 
 		 346 aa  89  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  33.7 
 
 		 831 aa  87  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  30.62 
 
 		 752 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  34.97 
 
 		 930 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  30 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  28.5 
 
 		 1293 aa  84  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  30.26 
 
 		 627 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  29.48 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  30.77 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  36.36 
 
 		 709 aa  80.9  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  31.82 
 
 		 579 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  24.9 
 
 		 639 aa  75.5  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  28.72 
 
 		 522 aa  73.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  36.07 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.57 
 
 		 343 aa  72.8  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  30.97 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  35.29 
 
 		 1146 aa  70.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  27.27 
 
 		 372 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  30.86 
 
 		 307 aa  70.1  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  31.71 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  27.8 
 
 		 387 aa  69.7  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.89 
 
 		 1163 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  31.82 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  33.7 
 
 		 898 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  31.71 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  27.16 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  29.76 
 
 		 436 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  37.07 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  39.06 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  31.9 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  29.84 
 
 		 899 aa  63.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1068 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  23.04 
 
 		 384 aa  63.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  30.9 
 
 		 888 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  27.88 
 
 		 588 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  29.03 
 
 		 1140 aa  62.4  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  26.4 
 
 		 521 aa  62.4  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  24.78 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  27.57 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  33.05 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  34.15 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  27.05 
 
 		 361 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.12 
 
 		 1834 aa  60.1  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  25.59 
 
 		 396 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  25.56 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  27.49 
 
 		 1030 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  31.91 
 
 		 373 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  30.6 
 
 		 322 aa  57  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  26.38 
 
 		 364 aa  57  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  26.14 
 
 		 343 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  25.73 
 
 		 353 aa  56.2  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1177 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  26.47 
 
 		 355 aa  55.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  31.16 
 
 		 786 aa  55.1  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 1230 aa  53.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  28.19 
 
 		 906 aa  53.5  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  29.48 
 
 		 937 aa  53.5  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 		 683 aa  53.5  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  29.77 
 
 		 279 aa  53.5  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  28.79 
 
 		 412 aa  53.5  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  28.48 
 
 		 315 aa  52  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  27.37 
 
 		 913 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  26.86 
 
 		 354 aa  51.6  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 		 678 aa  51.6  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  26.8 
 
 		 315 aa  51.6  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  36.14 
 
 		 318 aa  51.2  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  24.04 
 
 		 892 aa  51.2  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  27.36 
 
 		 395 aa  50.8  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  32.06 
 
 		 647 aa  48.5  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  28.95 
 
 		 405 aa  48.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5035  NHL repeat containing protein  27.03 
 
 		 455 aa  48.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0114728  decreased coverage  0.00343119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  30.25 
 
 		 805 aa  48.1  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 		 863 aa  47.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  31.05 
 
 		 404 aa  47.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  23.56 
 
 		 1130 aa  47.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  25.99 
 
 		 732 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4285  hypothetical protein  27.32 
 
 		 361 aa  47  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.380476  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  24.49 
 
 		 903 aa  47  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.08 
 
 		 693 aa  46.2  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  23.91 
 
 		 439 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.59 
 
 		 1292 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  36 
 
 		 584 aa  45.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  24.39 
 
 		 318 aa  45.8  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  31.5 
 
 		 386 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  39.13 
 
 		 326 aa  45.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  31.03 
 
 		 211 aa  45.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  22.34 
 
 		 1351 aa  44.7  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  29.37 
 
 		 630 aa  44.7  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  25.16 
 
 		 328 aa  43.9  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2800  NHL repeat-containing protein  28.66 
 
 		 538 aa  43.9  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350365  normal  0.74213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>